PTPRF

PTPRF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1LAR, 2DJU, 2EDX, 2EDY, 2YD5, 2YD8, 4N5U, 2DN7
Ідентифікатори
Символи	PTPRF, LAR, BNAH2, protein tyrosine phosphatase, receptor type F, protein tyrosine phosphatase receptor type F
Зовнішні ІД	OMIM: 179590 MGI: 102695 HomoloGene: 20623 GeneCards: PTPRF
Пов'язані генетичні захворювання
	бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chondroitin sulfate proteoglycan binding; • heparin binding; • phosphoprotein phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • protein tyrosine phosphatase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • hydrolase activity; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • neuronal cell body; • neuron projection; • екзосома; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• neuron projection regeneration; • regulation of axon regeneration; • negative regulation of receptor binding; • regulation of neuron projection development; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway; • адгезія клітин; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • cell migration; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • synaptic membrane adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5792
	19268
	ENSG00000142949
	ENSMUSG00000033295
	P10586
	A2A8L5
NM_002840; NM_130440; NM_001329137; NM_001329138; NM_001329139;
	NM_001329140
	NM_011213
NP_001316066; NP_001316067; NP_001316068; NP_001316069; NP_002831;
	NP_569707
	NP_035343
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRF (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 907 амінокислот, а молекулярна маса — 212 879^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPEPAPGRT	MVPLVPALVM	LGLVAGAHGD	SKPVFIKVPE	DQTGLSGGVA
SFVCQATGEP	KPRITWMKKG	KKVSSQRFEV	IEFDDGAGSV	LRIQPLRVQR
DEAIYECTAT	NSLGEINTSA	KLSVLEEEQL	PPGFPSIDMG	PQLKVVEKAR
TATMLCAAGG	NPDPEISWFK	DFLPVDPATS	NGRIKQLRSG	ALQIESSEES
DQGKYECVAT	NSAGTRYSAP	ANLYVRVRRV	APRFSIPPSS	QEVMPGGSVN
LTCVAVGAPM	PYVKWMMGAE	ELTKEDEMPV	GRNVLELSNV	VRSANYTCVA
ISSLGMIEAT	AQVTVKALPK	PPIDLVVTET	TATSVTLTWD	SGNSEPVTYY
GIQYRAAGTE	GPFQEVDGVA	TTRYSIGGLS	PFSEYAFRVL	AVNSIGRGPP
SEAVRARTGE	QAPSSPPRRV	QARMLSASTM	LVQWEPPEEP	NGLVRGYRVY
YTPDSRRPPN	AWHKHNTDAG	LLTTVGSLLP	GITYSLRVLA	FTAVGDGPPS
PTIQVKTQQG	VPAQPADFQA	EVESDTRIQL	SWLLPPQERI	IMYELVYWAA
EDEDQQHKVT	FDPTSSYTLE	DLKPDTLYRF	QLAARSDMGV	GVFTPTIEAR
TAQSTPSAPP	QKVMCVSMGS	TTVRVSWVPP	PADSRNGVIT	QYSVAYEAVD
GEDRGRHVVD	GISREHSSWD	LVGLEKWTEY	RVWVRAHTDV	GPGPESSPVL
VRTDEDVPSG	PPRKVEVEPL	NSTAVHVYWK	LPVPSKQHGQ	IRGYQVTYVR
LENGEPRGLP	IIQDVMLAEA	QWRPEESEDY	ETTISGLTPE	TTYSVTVAAY
TTKGDGARSK	PKIVTTTGAV	PGRPTMMIST	TAMNTALLQW	HPPKELPGEL
LGYRLQYCRA	DEARPNTIDF	GKDDQHFTVT	GLHKGTTYIF	RLAAKNRAGL
GEEFEKEIRT	PEDLPSGFPQ	NLHVTGLTTS	TTELAWDPPV	LAERNGRIIS
YTVVFRDINS	QQELQNITTD	TRFTLTGLKP	DTTYDIKVRA	WTSKGSGPLS
PSIQSRTMPV	EQVFAKNFRV	AAAMKTSVLL	SWEVPDSYKS	AVPFKILYNG
QSVEVDGHSM	RKLIADLQPN	TEYSFVLMNR	GSSAGGLQHL	VSIRTAPDLL
PHKPLPASAY	IEDGRFDLSM	PHVQDPSLVR	WFYIVVVPID	RVGGSMLTPR
WSTPEELELD	ELLEAIEQGG	EEQRRRRRQA	ERLKPYVAAQ	LDVLPETFTL
GDKKNYRGFY	NRPLSPDLSY	QCFVLASLKE	PMDQKRYASS	PYSDEIVVQV
TPAQQQEEPE	MLWVTGPVLA	VILIILIVIA	ILLFKRKRTH	SPSSKDEQSI
GLKDSLLAHS	SDPVEMRRLN	YQTPGMRDHP	PIPITDLADN	IERLKANDGL
KFSQEYESID	PGQQFTWENS	NLEVNKPKNR	YANVIAYDHS	RVILTSIDGV
PGSDYINANY	IDGYRKQNAY	IATQGPLPET	MGDFWRMVWE	QRTATVVMMT
RLEEKSRVKC	DQYWPARGTE	TCGLIQVTLL	DTVELATYTV	RTFALHKSGS
SEKRELRQFQ	FMAWPDHGVP	EYPTPILAFL	RRVKACNPLD	AGPMVVHCSA
GVGRTGCFIV	IDAMLERMKH	EKTVDIYGHV	TCMRSQRNYM	VQTEDQYVFI
HEALLEAATC	GHTEVPARNL	YAHIQKLGQV	PPGESVTAME	LEFKLLASSK
AHTSRFISAN	LPCNKFKNRL	VNIMPYELTR	VCLQPIRGVE	GSDYINASFL
DGYRQQKAYI	ATQGPLAEST	EDFWRMLWEH	NSTIIVMLTK	LREMGREKCH
QYWPAERSAR	YQYFVVDPMA	EYNMPQYILR	EFKVTDARDG	QSRTIRQFQF
TDWPEQGVPK	TGEGFIDFIG	QVHKTKEQFG	QDGPITVHCS	AGVGRTGVFI
TLSIVLERMR	YEGVVDMFQT	VKTLRTQRPA	MVQTEDQYQL	CYRAALEYLG
SFDHYAT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані.

Література

Streuli M., Krueger N.X., Hall L.R., Schlossman S.F., Saito H. (1988). A new member of the immunoglobulin superfamily that has a cytoplasmic region homologous to the leukocyte common antigen. J. Exp. Med. 168: 1523—1530. PMID 2972792 DOI:10.1084/jem.168.5.1523
Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Streuli M., Krueger N.X., Tsai A.Y.M., Saito H. (1989). A family of receptor-linked protein tyrosine phosphatases in humans and Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 8698—8702. PMID 2554325 DOI:10.1073/pnas.86.22.8698
Ahmad F., Goldstein B.J. (1997). Functional association between the insulin receptor and the transmembrane protein-tyrosine phosphatase LAR in intact cells. J. Biol. Chem. 272: 448—457. PMID 8995282 DOI:10.1074/jbc.272.11.7519
Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611