PTPRK

PTPRK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2C7S
Ідентифікатори
Символи	PTPRK, R-PTP-kappa, protein tyrosine phosphatase, receptor type K, protein tyrosine phosphatase receptor type K
Зовнішні ІД	OMIM: 602545 MGI: 103310 HomoloGene: 55693 GeneCards: PTPRK
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-catenin binding • phosphoprotein phosphatase activity • gamma-catenin binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • protein kinase binding • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • Адгезивні контакти • photoreceptor outer segment • integral component of plasma membrane • cell surface • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • leading edge membrane • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • negative regulation of keratinocyte proliferation • cellular response to UV • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of cell cycle • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • focal adhesion assembly • адгезія клітин • negative regulation of cell migration • protein localization to cell surface • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • neuron projection development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5796	19272
Ensembl	ENSG00000152894 ENSG00000273993	ENSMUSG00000019889
UniProt	Q15262	P35822
RefSeq (мРНК)	NM_001135648 NM_001291981 NM_001291982 NM_001291983 NM_001291984 NM_002844	NM_008983 NM_001359355 NM_001359356
RefSeq (білок)	NP_001129120 NP_001278910 NP_001278911 NP_001278912 NP_001278913 NP_002835	NP_033009 NP_001346284 NP_001346285
Локус (UCSC)	Хр. 6: 127.97 – 128.52 Mb	Хр. 10: 27.95 – 28.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRK (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 439 амінокислот, а молекулярна маса — 162 102.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTTAAAALP		AFVALLLLSP		WPLLGSAQGQ		FSAGGCTFDD		GPGACDYHQD
LYDDFEWVHV		SAQEPHYLPP		EMPQGSYMIV		DSSDHDPGEK		ARLQLPTMKE
NDTHCIDFSY		LLYSQKGLNP		GTLNILVRVN		KGPLANPIWN		VTGFTGRDWL
RAELAVSTFW		PNEYQVIFEA		EVSGGRSGYI		AIDDIQVLSY		PCDKSPHFLR
LGDVEVNAGQ		NATFQCIATG		RDAVHNKLWL		QRRNGEDIPV		AQTKNINHRR
FAASFRLQEV		TKTDQDLYRC		VTQSERGSGV		SNFAQLIVRE		PPRPIAPPQL
LGVGPTYLLI		QLNANSIIGD		GPIILKEVEY		RMTSGSWTET		HAVNAPTYKL
WHLDPDTEYE		IRVLLTRPGE		GGTGLPGPPL		ITRTKCAEPM		RTPKTLKIAE
IQARRIAVDW		ESLGYNITRC		HTFNVTICYH		YFRGHNESKA		DCLDMDPKAP
QHVVNHLPPY		TNVSLKMILT		NPEGRKESEE		TIIQTDEDVP		GPVPVKSLQG
TSFENKIFLN		WKEPLDPNGI		ITQYEISYSS		IRSFDPAVPV		AGPPQTVSNL
WNSTHHVFMH		LHPGTTYQFF		IRASTVKGFG		PATAINVTTN		ISAPTLPDYE
GVDASLNETA		TTITVLLRPA		QAKGAPISAY		QIVVEELHPH		RTKREAGAME
CYQVPVTYQN		AMSGGAPYYF		AAELPPGNLP		EPAPFTVGDN		RTYQGFWNPP
LAPRKGYNIY		FQAMSSVEKE		TKTQCVRIAT		KAATEEPEVI		PDPAKQTDRV
VKIAGISAGI		LVFILLLLVV		ILIVKKSKLA		KKRKDAMGNT		RQEMTHMVNA
MDRSYADQST		LHAEDPLSIT		FMDQHNFSPR		YENHSATAES		SRLLDVPRYL
CEGTESPYQT		GQLHPAIRVA		DLLQHINLMK		TSDSYGFKEE		YESFFEGQSA
SWDVAKKDQN		RAKNRYGNII		AYDHSRVILQ		PVEDDPSSDY		INANYIDGYQ
RPSHYIATQG		PVHETVYDFW		RMIWQEQSAC		IVMVTNLVEV		GRVKCYKYWP
DDTEVYGDFK		VTCVEMEPLA		EYVVRTFTLE		RRGYNEIREV		KQFHFTGWPD
HGVPYHATGL		LSFIRRVKLS		NPPSAGPIVV		HCSAGAGRTG		CYIVIDIMLD
MAEREGVVDI		YNCVKALRSR		RINMVQTEEQ		YIFIHDAILE		ACLCGETAIP
VCEFKAAYFD		MIRIDSQTNS		SHLKDEFQTL		NSVTPRLQAE		DCSIACLPRN
HDKNRFMDML		PPDRCLPFLI		TIDGESSNYI		NAALMDSYRQ		PAAFIVTQYP
LPNTVKDFWR		LVYDYGCTSI		VMLNEVDLSQ		GCPQYWPEEG		MLRYGPIQVE
CMSCSMDCDV		INRIFRICNL		TRPQEGYLMV		QQFQYLGWAS		HREVPGSKRS
FLKLILQVEK		WQEECEEGEG		RTIIHCLNGG		GRSGMFCAIG		IVVEMVKRQN
VVDVFHAVKT		LRNSKPNMVE		APEQYRFCYD		VALEYLESS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Fuchs M., Mueller T., Lerch M., Ullrich A. (1996). Association of human protein-tyrosine phosphatase kappa with members of the armadillo family. J. Biol. Chem. 271: 16712—16719. PMID 8663237 DOI:10.1074/jbc.271.28.16712
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6