PTPRR

PTPRR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A8B
Ідентифікатори
Символи	PTPRR, EC-PTP, PCPTP1, PTP-SL, PTPBR7, PTPRQ, protein tyrosine phosphatase, receptor type R, protein tyrosine phosphatase receptor type R
Зовнішні ІД	OMIM: 602853 MGI: 109559 HomoloGene: 2135 GeneCards: PTPRR
Пов'язані генетичні захворювання
аметропія
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • protein kinase binding • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • міжклітинний простір • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • in utero embryonic development • ERBB2 signaling pathway • regulation of homophilic cell adhesion • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • negative regulation of epithelial cell migration • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5801	19279
Ensembl	ENSG00000153233	ENSMUSG00000020151
UniProt	Q15256	Q62132
RefSeq (мРНК)	NM_001207015 NM_001207016 NM_002849 NM_130846	NM_001161837 NM_001161838 NM_001161839 NM_001161840 NM_011217 NM_001358484
RefSeq (білок)	NP_001193944 NP_001193945 NP_002840 NP_570897	NP_001155309 NP_001155310 NP_001155311 NP_001155312 NP_035347 NP_001345413
Локус (UCSC)	Хр. 12: 70.64 – 70.92 Mb	Хр. 10: 115.85 – 116.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRR (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type R) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 73 834.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRAVCFPAL		CLLLNLHAAG		CFSGNNDHFL		AINQKKSGKP		VFIYKHSQDI
EKSLDIAPQK		IYRHSYHSSS		EAQVSKRHQI		VNSAFPRPAY		DPSLNLLAMD
GQDLEVENLP		IPAANVIVVT		LQMDVNKLNI		TLLRIFRQGV		AAALGLLPQQ
VHINRLIGKK		NSIELFVSPI		NRKTGISDAL		PSEEVLRSLN		INVLHQSLSQ
FGITEVSPEK		NVLQGQHEAD		KIWSKEGFYA		VVIFLSIFVI		IVTCLMILYR
LKERFQLSLR		QDKEKNQEIH		LSPITLQPAL		SEAKTVHSMV		QPEQAPKVLN
VVVDPQGRGA		PEIKATTATS		VCPSPFKMKP		IGLQERRGSN		VSLTLDMSSL
GNIEPFVSIP		TPREKVAMEY		LQSASRILTR		SQLRDVVASS		HLLQSEFMEI
PMNFVDPKEI		DIPRHGTKNR		YKTILPNPLS		RVCLRPKNVT		DSLSTYINAN
YIRGYSGKEK		AFIATQGPMI		NTVDDFWQMV		WQEDSPVIVM		ITKLKEKNEK
CVLYWPEKRG		IYGKVEVLVI		SVNECDNYTI		RNLVLKQGSH		TQHVKHYWYT
SWPDHKTPDS		AQPLLQLMLD		VEEDRLASQG		RGPVVVHCSA		GIGRTGCFIA
TSIGCQQLKE		EGVVDALSIV		CQLRMDRGGM		VQTSEQYEFV		HHALCLYESR
LSAETVQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Shiozuka K., Watanabe Y., Ikeda T., Hashimoto S., Kawashima H. (1995). Cloning and expression of PCPTP1 encoding protein tyrosine phosphatase. Gene. 162: 279—284. PMID 7557444 DOI:10.1016/0378-1119(95)00306-Q
• Bektas A., Hughes J.N., Warram J.H., Krolewski A.S., Doria A. (2001). Type 2 diabetes locus on 12q15: further mapping and mutation screening of two candidate genes. Diabetes. 50: 204—208. PMID 11147789 DOI:10.2337/diabetes.50.1.204

Див. також

• Хромосома 12