PUM2

PUM2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3Q0Q, 3Q0R, 3Q0S
Ідентифікатори
Символи	PUM2, PUMH2, PUML2, pumilio RNA binding family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607205 MGI: 1931751 HomoloGene: 69183 GeneCards: PUM2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • mRNA 3'-UTR binding; • miRNA binding;
Клітинна компонента	• perinuclear region of cytoplasm; • cytoplasmic stress granule; • ядерна мембрана; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• regulation of chromosome segregation; • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA; • positive regulation of RIG-I signaling pathway; • regulation of translation; • regulation of mRNA stability; • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA; • stress granule assembly; • posttranscriptional regulation of gene expression; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23369
	80913
	ENSG00000055917
	ENSMUSG00000020594
	Q8TB72
	Q80U58
NM_001282752; NM_001282790; NM_001282791; NM_015317; NM_001352917;
	NM_001352918; NM_001352919; NM_001352920; NM_001352923; NM_001352925; NM_001352926; NM_001352927; NM_001352928; NM_001352929; NM_001352930
NM_001160219; NM_001160220; NM_001160221; NM_001160222; NM_030723;
	NM_001310519
NP_001269681; NP_001269719; NP_001269720; NP_056132; NP_001339846;
	NP_001339847; NP_001339848; NP_001339849; NP_001339852; NP_001339854; NP_001339855; NP_001339856; NP_001339857; NP_001339858; NP_001339859
NP_001153691; NP_001153692; NP_001153693; NP_001153694; NP_001297448;
	NP_109648
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PUM2 (англ. Pumilio RNA binding family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот, а молекулярна маса — 114 216^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNHDFQALAL	ESRGMGELLP	TKKFWEPDDS	TKDGQKGIFL	GDDEWRETAW
GASHHSMSQP	IMVQRRSGQG	FHGNSEVNAI	LSPRSESGGL	GVSMVEYVLS
SSPADKLDSR	FRKGNFGTRD	AETDGPEKGD	QKGKASPFEE	DQNRDLKQGD
DDDSKINGRG	LPNGMDADCK	DFNRTPGSRQ	ASPTEVVERL	GPNTNPSEGL
GPLPNPTANK	PLVEEFSNPE	TQNLDAMEQV	GLESLQFDYP	GNQVPMDSSG
ATVGLFDYNS	QQQLFQRTNA	LTVQQLTAAQ	QQQYALAAAQ	QPHIAGVFSA
GLAPAAFVPN	PYIISAAPPG	TDPYTAAGLA	AAATLAGPAV	VPPQYYGVPW
GVYPANLFQQ	QAAAAANNTA	SQQAASQAQP	GQQQVLRAGA	GQRPLTPNQG
QQGQQAESLA	AAAAANPTLA	FGQGLATGMP	GYQVLAPTAY	YDQTGALVVG
PGARTGLGAP	VRLMAPTPVL	ISSAAAQAAA	AAAAGGTASS	LTGSTNGLFR
PIGTQPPQQQ	QQQPSTNLQS	NSFYGSSSLT	NSSQSSSLFS	HGPGQPGSTS
LGFGSGNSLG	AAIGSALSGF	GSSVGSSASS	SATRRESLST	SSDLYKRSSS
SLAPIGQPFY	NSLGFSSSPS	PIGMPLPSQT	PGHSLTPPPS	LSSHGSSSSL
HLGGLTNGSG	RYISAAPGAE	AKYRSASSTS	SLFSSSSQLF	PPSRLRYNRS
DIMPSGRSRL	LEDFRNNRFP	NLQLRDLIGH	IVEFSQDQHG	SRFIQQKLER
ATPAERQMVF	NEILQAAYQL	MTDVFGNYVI	QKFFEFGSLD	QKLALATRIR
GHVLPLALQM	YGCRVIQKAL	ESISSDQQVI	SEMVKELDGH	VLKCVKDQNG
NHVVQKCIEC	VQPQSLQFII	DAFKGQVFVL	STHPYGCRVI	QRILEHCTAE
QTLPILEELH	QHTEQLVQDQ	YGNYVIQHVL	EHGRPEDKSK	IVSEIRGKVL
ALSQHKFASN	VVEKCVTHAS	RAERALLIDE	VCCQNDGPHS	ALYTMMKDQY
ANYVVQKMID	MAEPAQRKII	MHKIRPHITT	LRKYTYGKHI	LAKLEKYYLK
NSPDLGPIGG	PPNGML

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Spassov D.S., Jurecic R. (2002). Cloning and comparative sequence analysis of PUM1 and PUM2 genes, human members of the Pumilio family of RNA-binding proteins. Gene. 299: 195—204. PMID 12459267 doi:10.1016/S0378-1119(02)01060-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Miles W.O., Tschop K., Herr A., Ji J.Y., Dyson N.J. (2012). Pumilio facilitates miRNA regulation of the E2F3 oncogene. Genes Dev. 26: 356—368. PMID 22345517 doi:10.1101/gad.182568.111
Lu G., Hall T.M. (2011). Alternate modes of cognate RNA recognition by human PUMILIO proteins. Structure. 19: 361—367. PMID 21397187 doi:10.1016/j.str.2010.12.019

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14958 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8TB72 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14958 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8TB72 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]