RAB4A

RAB4A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YU9, 1Z0K, 2BMD, 2BME
Ідентифікатори
Символи	RAB4A, HRES-1, HRES-1/RAB4, HRES1, RAB4, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179511 MGI: 105069 HomoloGene: 101538 GeneCards: RAB4A
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GDP binding • ATPase binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • ATPase activator activity • syntaxin binding • ionotropic glutamate receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • recycling endosome • везикула • гіалоплазма • ендосома • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • insulin-responsive compartment • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • postsynaptic recycling endosome • early endosome membrane • recycling endosome membrane • anchored component of synaptic vesicle membrane Біологічний процес • regulation of endocytosis • antigen processing and presentation • positive regulation of ATP-dependent activity • Rab protein signal transduction • protein transport • phosphatidylinositol biosynthetic process • intracellular protein transport • small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5867	19341
Ensembl	ENSG00000168118	ENSMUSG00000019478
UniProt	P20338	P56371
RefSeq (мРНК)	NM_001271998 NM_004578	NM_009003
RefSeq (білок)	NP_001258927 NP_004569 NP_004569.2	NP_033029
Локус (UCSC)	Хр. 1: 229.27 – 229.31 Mb	Хр. 8: 124.53 – 124.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB4A (англ. RAB4A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 218 амінокислот, а молекулярна маса — 24 390.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQTAMSETY		DFLFKFLVIG		NAGTGKSCLL		HQFIEKKFKD		DSNHTIGVEF
GSKIINVGGK		YVKLQIWDTA		GQERFRSVTR		SYYRGAAGAL		LVYDITSRET
YNALTNWLTD		ARMLASQNIV		IILCGNKKDL		DADREVTFLE		ASRFAQENEL
MFLETSALTG		ENVEEAFVQC		ARKILNKIES		GELDPERMGS		GIQYGDAALR
QLRSPRRAQA		PNAQECGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• de Renzis S., Soennichsen B., Zerial M. (2002). Divalent Rab effectors regulate the sub-compartmental organization and sorting of early endosomes. Nat. Cell Biol. 4: 124—133. PMID 11788822 DOI:10.1038/ncb744
• Lindsay A.J., McCaffrey M.W. (2004). Characterisation of the Rab binding properties of Rab coupling protein (RCP) by site-directed mutagenesis. FEBS Lett. 571: 86—92. PMID 15280022 DOI:10.1016/j.febslet.2004.06.068
• Huber S.K., Scheidig A.J. (2005). High resolution crystal structures of human Rab4a in its active and inactive conformations. FEBS Lett. 579: 2821—2829. PMID 15907487 DOI:10.1016/j.febslet.2005.04.020
• Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798
• Zahraoui A., Touchot N., Chardin P., Tavitian A. (1989). The human Rab genes encode a family of GTP-binding proteins related to yeast YPT1 and SEC4 products involved in secretion. J. Biol. Chem. 264: 12394—12401. PMID 2501306

Див. також

• Хромосома 1