RAB5A

RAB5A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N6H, 1N6I, 1N6K, 1N6L, 1N6N, 1N6O, 1N6P, 1N6R, 1R2Q, 1TU3, 1TU4, 3MJH, 4Q9U
Ідентифікатори
Символи	RAB5A, RAB5, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179512 MGI: 105926 HomoloGene: 68142 GeneCards: RAB5A
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GDP binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • guanyl nucleotide binding Клітинна компонента • цитоплазма • axon terminus • ендосома • cell projection • мембрана • Синаптичні бульбашки • Меланосома • ruffle • клітинна мембрана • endocytic vesicle • аксон • neuronal cell body • terminal bouton • дендрит (нейробіологія) • somatodendritic compartment • early endosome • phagocytic vesicle • actin cytoskeleton • membrane raft • cytoplasmic side of early endosome membrane • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • phagocytic vesicle membrane • гіалоплазма • endosome membrane • clathrin-coated vesicle membrane • early endosome membrane • early phagosome • postsynaptic early endosome • anchored component of synaptic vesicle membrane Біологічний процес • regulation of endocytosis • regulation of filopodium assembly • ендоцитоз • зсідання крові • receptor internalization involved in canonical Wnt signaling pathway • regulation of autophagosome assembly • synaptic vesicle recycling • early endosome to late endosome transport • GO:0015915 транспорт • protein transport • positive regulation of exocytosis • regulation of synaptic vesicle exocytosis • regulation of endosome size • viral RNA genome replication • Фагоцитоз • phosphatidylinositol biosynthetic process • membrane organization • посттрансляційна модифікація • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • amyloid-beta clearance by transcytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5868	271457
Ensembl	ENSG00000144566	ENSMUSG00000017831
UniProt	P20339	Q9CQD1
RefSeq (мРНК)	NM_004162 NM_001292048	NM_025887
RefSeq (білок)	NP_001278977 NP_004153	NP_080163
Локус (UCSC)	Хр. 3: 19.95 – 19.99 Mb	Хр. 17: 53.79 – 53.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB5A (англ. RAB5A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 23 659.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASRGATRPN		GPNTGNKICQ		FKLVLLGESA		VGKSSLVLRF		VKGQFHEFQE
STIGAAFLTQ		TVCLDDTTVK		FEIWDTAGQE		RYHSLAPMYY		RGAQAAIVVY
DITNEESFAR		AKNWVKELQR		QASPNIVIAL		SGNKADLANK		RAVDFQEAQS
YADDNSLLFM		ETSAKTSMNV		NEIFMAIAKK		LPKNEPQNPG		ANSARGRGVD
LTEPTQPTRN		QCCSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• Farnsworth C.C., Seabra M.C., Ericsson L.H., Gelb M.H., Glomset J.A. (1994). Rab geranylgeranyl transferase catalyzes the geranylgeranylation of adjacent cysteines in the small GTPases Rab1A, Rab3A, and Rab5A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 11963—11967. PMID 7991565 DOI:10.1073/pnas.91.25.11963
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Callaghan J.M., Nixon S., Bucci C., Toh B.-H., Stenmark H. (1999). Direct interaction of EEA1 with Rab5b. Eur. J. Biochem. 265: 361—366. PMID 10491193 DOI:10.1046/j.1432-1327.1999.00743.x
• Tall G.G., Barbieri M.A., Stahl P.D., Horazdovsky B.F. (2001). Ras-activated endocytosis is mediated by the Rab5 guanine nucleotide exchange activity of RIN1. Dev. Cell. 1: 73—82. PMID 11703925 DOI:10.1016/S1534-5807(01)00008-9
• Gauthier-Campbell C., Bredt D.S., Murphy T.H., El-Husseini A. (2004). Regulation of dendritic branching and filopodia formation in hippocampal neurons by specific acylated protein motifs. Mol. Biol. Cell. 15: 2205—2217. PMID 14978216 DOI:10.1091/mbc.E03-07-0493
• Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798

Див. також

• Хромосома 3