RAB5C

RAB5C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4KYI
Ідентифікатори
Символи	RAB5C, L1880, RAB5CL, RAB5L, RABL, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 604037 MGI: 105306 HomoloGene: 55533 GeneCards: RAB5C
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • Меланосома • lysosomal membrane • ендосома • lipid droplet • endocytic vesicle • early endosome • екзосома • мембрана • клітинна мембрана • early endosome membrane • azurophil granule membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • anchored component of synaptic vesicle membrane • внутрішньоклітинний Біологічний процес • protein transport • regulation of endocytosis • plasma membrane to endosome transport • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5878	19345
Ensembl	ENSG00000108774	ENSMUSG00000019173
UniProt	P51148	P35278
RefSeq (мРНК)	NM_001252039 NM_004583 NM_201434	NM_024456 NM_001305003
RefSeq (білок)	NP_001238968 NP_004574 NP_958842	NP_001291932 NP_077776
Локус (UCSC)	Хр. 17: 42.12 – 42.16 Mb	Хр. 11: 100.61 – 100.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB5C (англ. RAB5C, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 216 амінокислот, а молекулярна маса — 23 483.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGRGGAARP		NGPAAGNKIC		QFKLVLLGES		AVGKSSLVLR		FVKGQFHEYQ
ESTIGAAFLT		QTVCLDDTTV		KFEIWDTAGQ		ERYHSLAPMY		YRGAQAAIVV
YDITNTDTFA		RAKNWVKELQ		RQASPNIVIA		LAGNKADLAS		KRAVEFQEAQ
AYADDNSLLF		METSAKTAMN		VNEIFMAIAK		KLPKNEPQNA		TGAPGRNRGV
DLQENNPASR		SQCCSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

• Clemens D.L., Lee B.-Y., Horwitz M.A. (2000). Deviant expression of Rab5 on phagosomes containing the intracellular pathogens Mycobacterium tuberculosis and Legionella pneumophila is associated with altered phagosomal fate. Infect. Immun. 68: 2671—2684. PMID 10768959 DOI:10.1128/IAI.68.5.2671-2684.2000
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Merithew E., Stone C., Eathiraj S., Lambright D.G. (2003). Determinants of Rab5 interaction with the N-terminus of early endosome antigen 1. J. Biol. Chem. 278: 8494—8500. PMID 12493736 DOI:10.1074/jbc.M211514200
• Han H.J., Sudo K., Inazawa J., Nakamura Y. (1996). Isolation and mapping of a human gene (RABL) encoding a small GTP-binding protein homologous to the Ras-related RAB gene. Cytogenet. Cell Genet. 73: 137—139. PMID 8646882

Див. також

• Хромосома 17