RACGAP1

RACGAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OVJ, 3W6R, 3WPQ, 3WPS, 4B6D, 5C2J, 5C2K
Ідентифікатори
Символи	RACGAP1, CYK4, HsCYK-4, ID-GAP, MgcRacGAP, Rac GTPase activating protein 1, CDAN3B
Зовнішні ІД	OMIM: 604980 MGI: 1349423 HomoloGene: 8077 GeneCards: RACGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • alpha-tubulin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • gamma-tubulin binding • protein kinase binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • centralspindlin complex • мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • веретено поділу • нуклеоплазма • Акросома • spindle midzone • Борозна розщеплення • mitotic spindle • мікротрубочка • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • midbody • Flemming body Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0007243 intracellular signal transduction • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • mitotic spindle midzone assembly • sulfate transport • mitotic cytokinesis • ion transport • поділ клітини • positive regulation of cytokinesis • multicellular organism development • microtubule-based movement • actomyosin contractile ring assembly • Сперматогенез • neuroblast proliferation • клітинний цикл • regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • regulation of embryonic development • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29127	26934
Ensembl	ENSG00000161800	ENSMUSG00000023015
UniProt	Q9H0H5	Q9WVM1
RefSeq (мРНК)	NM_001126103 NM_001126104 NM_013277 NM_001319999 NM_001320000 NM_001320001 NM_001320002 NM_001320003 NM_001320004 NM_001320005 NM_001320006 NM_001320007	NM_001253808 NM_001253809 NM_012025
RefSeq (білок)	NP_001119575 NP_001119576 NP_001306928 NP_001306929 NP_001306930 NP_001306931 NP_001306932 NP_001306933 NP_001306934 NP_001306935 NP_001306936 NP_037409	NP_001240737 NP_001240738 NP_036155
Локус (UCSC)	Хр. 12: 49.98 – 50.03 Mb	Хр. 15: 99.52 – 99.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RACGAP1 (англ. Rac GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 632 амінокислот, а молекулярна маса — 71 027.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTMMLNVRN		LFEQLVRRVE		ILSEGNEVQF		IQLAKDFEDF		RKKWQRTDHE
LGKYKDLLMK		AETERSALDV		KLKHARNQVD		VEIKRRQRAE		ADCEKLERQI
QLIREMLMCD		TSGSIQLSEE		QKSALAFLNR		GQPSSSNAGN		KRLSTIDESG
SILSDISFDK		TDESLDWDSS		LVKTFKLKKR		EKRRSTSRQF		VDGPPGPVKK
TRSIGSAVDQ		GNESIVAKTT		VTVPNDGGPI		EAVSTIETVP		YWTRSRRKTG
TLQPWNSDST		LNSRQLEPRT		ETDSVGTPQS		NGGMRLHDFV		SKTVIKPESC
VPCGKRIKFG		KLSLKCRDCR		VVSHPECRDR		CPLPCIPTLI		GTPVKIGEGM
LADFVSQTSP		MIPSIVVHCV		NEIEQRGLTE		TGLYRISGCD		RTVKELKEKF
LRVKTVPLLS		KVDDIHAICS		LLKDFLRNLK		EPLLTFRLNR		AFMEAAEITD
EDNSIAAMYQ		AVGELPQANR		DTLAFLMIHL		QRVAQSPHTK		MDVANLAKVF
GPTIVAHAVP		NPDPVTMLQD		IKRQPKVVER		LLSLPLEYWS		QFMMVEQENI
DPLHVIENSN		AFSTPQTPDI		KVSLLGPVTT		PEHQLLKTPS		SSSLSQRVRS
TLTKNTPRFG		SKSKSATNLG		RQGNFFASPM		LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, клітинний цикл, поділ клітини, диференціація клітин, сперматогенез, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 doi:10.1093/dnares/7.2.143
• Hirose K., Kawashima T., Iwamoto I., Nosaka T., Kitamura T. (2001). MgcRacGAP is involved in cytokinesis through associating with mitotic spindle and midbody. J. Biol. Chem. 276: 5821—5828. PMID 11085985 doi:10.1074/jbc.M007252200
• Mishima M., Kaitna S., Glotzer M. (2002). Central spindle assembly and cytokinesis require a kinesin-like protein/RhoGAP complex with microtubule bundling activity. Dev. Cell. 2: 41—54. PMID 11782313 doi:10.1016/S1534-5807(01)00110-1
• Lee J.S., Kamijo K., Ohara N., Kitamura T., Miki T. (2004). MgcRacGAP regulates cortical activity through RhoA during cytokinesis. Exp. Cell Res. 293: 275—282. PMID 14729465 doi:10.1016/j.yexcr.2003.10.015
• Ban R., Irino Y., Fukami K., Tanaka H. (2004). Human mitotic spindle-associated protein PRC1 inhibits MgcRacGAP activity toward Cdc42 during the metaphase. J. Biol. Chem. 279: 16394—16402. PMID 14744859 doi:10.1074/jbc.M313257200

Див. також

• Хромосома 12