RAD23A

RAD23A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DV0, 1F4I, 1IFY, 1OQY, 1P98, 1P9D, 1QZE, 1TP4, 2WYQ
Ідентифікатори
Символи	RAD23A, HHR23A, HR23A, RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein
Зовнішні ІД	OMIM: 600061 MGI: 105126 HomoloGene: 48322 GeneCards: RAD23A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding; • ubiquitin-specific protease binding; • damaged DNA binding; • polyubiquitin modification-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • kinase binding; • ubiquitin binding; • proteasome binding;
Клітинна компонента	• Протеасома; • нуклеоплазма; • центр організації мікротрубочок; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair; • positive regulation of viral genome replication; • GO:0022415 viral process; • GO:0100026 Репарація ДНК; • cellular response to DNA damage stimulus; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein deubiquitination; • protein destabilization; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • positive regulation of cell cycle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5886
	19358
	ENSG00000179262
	ENSMUSG00000003813
	P54725
	P54726
	NM_001270362; NM_001270363; NM_005053
NM_001297606; NM_001297607; NM_009010; NM_001378894; NM_001378895;
	NM_001378896
	NP_001257291; NP_001257292; NP_005044
NP_001284535; NP_001284536; NP_033036; NP_001365823; NP_001365824;
	NP_001365825
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAD23A (англ. RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 363 амінокислот, а молекулярна маса — 39 609^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVTITLKTL	QQQTFKIRME	PDETVKVLKE	KIEAEKGRDA	FPVAGQKLIY
AGKILSDDVP	IRDYRIDEKN	FVVVMVTKTK	AGQGTSAPPE	ASPTAAPESS
TSFPPAPTSG	MSHPPPAARE	DKSPSEESAP	TTSPESVSGS	VPSSGSSGRE
EDAASTLVTG	SEYETMLTEI	MSMGYERERV	VAALRASYNN	PHRAVEYLLT
GIPGSPEPEH	GSVQESQVSE	QPATEAAGEN	PLEFLRDQPQ	FQNMRQVIQQ
NPALLPALLQ	QLGQENPQLL	QQISRHQEQF	IQMLNEPPGE	LADISDVEGE
VGAIGEEAPQ	MNYIQVTPQE	KEAIERLKAL	GFPESLVIQA	YFACEKNENL
AANFLLSQNF	DDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wang G., Sawai N., Kotliarova S., Kanazawa I., Nukina N. (2000). Ataxin-3, the MJD1 gene product, interacts with the two human homologs of yeast DNA repair protein RAD23, HHR23A and HHR23B. Hum. Mol. Genet. 9: 1795—1803. PMID 10915768 doi:10.1093/hmg/9.12.1795
Wang Q., Goh A.M., Howley P.M., Walters K.J. (2003). Ubiquitin recognition by the DNA repair protein hHR23a. Biochemistry. 42: 13529—13535. PMID 14621999 doi:10.1021/bi035391j
Raasi S., Pickart C.M. (2003). Rad23 ubiquitin-associated domains (UBA) inhibit 26 S proteasome-catalyzed proteolysis by sequestering lysine 48-linked polyubiquitin chains. J. Biol. Chem. 278: 8951—8959. PMID 12643283 doi:10.1074/jbc.M212841200
Raasi S., Orlov I., Fleming K.G., Pickart C.M. (2004). Binding of polyubiquitin chains to ubiquitin-associated (UBA) domains of HHR23A. J. Mol. Biol. 341: 1367—1379. PMID 15321727 doi:10.1016/j.jmb.2004.06.057
Chen L., Madura K. (2006). Evidence for distinct functions for human DNA repair factors hHR23A and hHR23B. FEBS Lett. 580: 3401—3408. PMID 16712842 doi:10.1016/j.febslet.2006.05.012

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9812 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P54725 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9812 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P54725 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]