RAP1A

RAP1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1C1Y, 1GUA, 3KUC, 4KVG
Ідентифікатори
Символи	RAP1A, C21KG, G-22K, KREV-1, KREV1, RAP1, SMGP21, member of RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179520 MGI: 97852 HomoloGene: 2162 GeneCards: RAP1A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • GDP binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • ендосома; • мембрана; • myelin sheath; • клітинна мембрана; • guanyl-nucleotide exchange factor complex; • neuron projection; • екзосома; • early endosome; • late endosome; • цитоплазма; • міжклітинні контакти; • perinuclear region of cytoplasm; • specific granule membrane; • phagocytic vesicle; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• establishment of endothelial barrier; • positive regulation of glucose import; • microvillus assembly; • regulation of cell junction assembly; • regulation of insulin secretion; • small GTPase mediated signal transduction; • Rap protein signal transduction; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • нейробіологія розвитку; • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis; • liver regeneration; • protein transport; • response to antineoplastic agent; • response to carbohydrate; • negative regulation of collagen biosynthetic process; • cellular response to glucose stimulus; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • nerve growth factor signaling pathway; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of protein kinase activity; • positive regulation of vasculogenesis; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • cellular response to cAMP; • positive regulation of neuron projection development; • neutrophil degranulation; • positive regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; • regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane; • protein localization to plasma membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5906
	109905
	ENSG00000116473
	ENSMUSG00000068798
	P62834
	P62835
NM_001010935; NM_001291896; NM_002884; NM_001370216; NM_001370217;
	NM_001394066
	NM_145541
	NP_001010935; NP_001278825; NP_002875; NP_001357145; NP_001357146
	NP_663516
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAP1A (англ. RAP1A, member of RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 184 амінокислот, а молекулярна маса — 20 987^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MREYKLVVLG	SGGVGKSALT	VQFVQGIFVE	KYDPTIEDSY	RKQVEVDCQQ
CMLEILDTAG	TEQFTAMRDL	YMKNGQGFAL	VYSITAQSTF	NDLQDLREQI
LRVKDTEDVP	MILVGNKCDL	EDERVVGKEQ	GQNLARQWCN	CAFLESSAKS
KINVNEIFYD	LVRQINRKTP	VEKKKPKKKS	CLLL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beraud-Dufour S., Gautier R., Albiges-Rizo C., Chardin P., Faurobert E. (2007). Krit 1 interactions with microtubules and membranes are regulated by Rap1 and integrin cytoplasmic domain associated protein-1. FEBS J. 274: 5518—5532. PMID 17916086 DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.06068.x
Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
Pizon V., Chardin P., Lerosey I., Olofsson B., Tavitian A. (1988). Human cDNAs rap1 and rap2 homologous to the Drosophila gene Dras3 encode proteins closely related to ras in the 'effector' region. Oncogene. 3: 201—204. PMID 3045729
Bokoch G.M., Parkos C.A., Mumby S.M. (1988). Purification and characterization of the 22,000-dalton GTP-binding protein substrate for ADP-ribosylation by botulinum toxin, G22K. J. Biol. Chem. 263: 16744—16749. PMID 3141412