RAP1GDS1

RAP1GDS1
Ідентифікатори
Символи	RAP1GDS1, GDS1, SmgGDS, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 179502 MGI: 2385189 HomoloGene: 41422 GeneCards: RAP1GDS1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • екзосома • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія Біологічний процес • negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration • positive regulation of mitochondrial calcium ion concentration • vascular associated smooth muscle contraction • myosin filament assembly • small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5910	229877
Ensembl	ENSG00000138698	ENSMUSG00000028149
UniProt	P52306	E9Q912
RefSeq (мРНК)	NM_001100426 NM_001100427 NM_001100428 NM_001100429 NM_001100430 NM_021159	NM_001040690 NM_001286759 NM_145544 NM_001356388
RefSeq (білок)	NP_001093896 NP_001093897 NP_001093898 NP_001093899 NP_001093900 NP_066982	NP_001035780 NP_001273688 NP_001343317 NP_663519
Локус (UCSC)	Хр. 4: 98.26 – 98.44 Mb	Хр. 3: 138.63 – 138.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAP1GDS1 (англ. Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 66 317.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDNLSDTLKK		LKITAVDKTE		DSLEGCLDCL		LQALAQNNTE		TSEKIQASGI
LQLFASLLTP		QSSCKAKVAN		IIAEVAKNEF		MRIPCVDAGL		ISPLVQLLNS
KDQEVLLQTG		RALGNICYDS		HEGRSAVDQA		GGAQIVIDHL		RSLCSITDPA
NEKLLTVFCG		MLMNYSNEND		SLQAQLINMG		VIPTLVKLLG		IHCQNAALTE
MCLVAFGNLA		ELESSKEQFA		STNIAEELVK		LFKKQIEHDK		REMIFEVLAP
LAENDAIKLQ		LVEAGLVECL		LEIVQQKVDS		DKEDDITELK		TGSDLMVLLL
LGDESMQKLF		EGGKGSVFQR		VLSWIPSNNH		QLQLAGALAI		ANFARNDANC
IHMVDNGIVE		KLMDLLDRHV		EDGNVTVQHA		ALSALRNLAI		PVINKAKMLS
AGVTEAVLKF		LKSEMPPVQF		KLLGTLRMLI		DAQAEAAEQL		GKNVKLVERL
VEWCEAKDHA		GVMGESNRLL		SALIRHSKSK		DVIKTIVQSG		GIKHLVTMAT
SEHVIMQNEA		LVALALIAAL		ELGTAEKDLE		SAKLVQILHR		LLADERSAPE
IKYNSMVLIC		ALMGSECLHK		EVQDLAFLDV		VSKLRSHENK		SVAQQASLTE
QRLTVES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.

Література

• Vikis H.G., Stewart S., Guan K.L. (2002). SmgGDS displays differential binding and exchange activity towards different Ras isoforms. Oncogene. 21: 2425—2432. PMID 11948427 DOI:10.1038/sj.onc.1205306
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4