RAPGEF2

RAPGEF2
Ідентифікатори
Символи	RAPGEF2, CNrasGEF, NRAPGEP, PDZ-GEF1, PDZGEF1, RA-GEF, RA-GEF-1, Rap-GEP, nRap GEP, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, RAGEF
Зовнішні ІД	OMIM: 609530 MGI: 2659071 HomoloGene: 35477 GeneCards: RAPGEF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • diacylglycerol binding; • signal transducer activity; • guanyl-nucleotide exchange factor activity; • WW domain binding; • phosphatidic acid binding; • PDZ domain binding; • cAMP binding; • cGMP binding; • beta-1 adrenergic receptor binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity;
Клітинна компонента	• cell-cell junction; • endocytic vesicle; • синапс; • integral component of plasma membrane; • apical plasma membrane; • bicellular tight junction; • ендосома; • міжклітинні контакти; • neuron projection; • neuronal cell body; • цитоплазма; • гіалоплазма; • late endosome; • мембрана; • клітинна мембрана; • perinuclear region of cytoplasm; • GO:0009327 protein-containing complex; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • cellular response to cGMP; • ventricular system development; • positive regulation of protein binding; • forebrain neuron development; • regulation of cell junction assembly; • protein localization to plasma membrane; • positive regulation of neuron projection development; • adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway; • нейробіологія розвитку; • neuron migration; • neuropeptide signaling pathway; • multicellular organism development; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • negative regulation of melanin biosynthetic process; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • диференціація клітин; • positive regulation of cAMP-mediated signaling; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • cellular response to cAMP; • nerve growth factor signaling pathway; • regulation of cell population proliferation; • Rap protein signal transduction; • small GTPase mediated signal transduction; • negative regulation of cell population proliferation; • blood vessel development; • positive regulation of dendritic cell apoptotic process; • positive regulation of vasculogenesis; • microvillus assembly; • negative regulation of dendrite morphogenesis; • regulation of synaptic plasticity; • neuron projection development; • establishment of endothelial intestinal barrier; • positive regulation of cAMP-dependent protein kinase activity; • positive regulation of neuron migration; • positive regulation of protein kinase activity; • establishment of endothelial barrier; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • MAPK cascade; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • cAMP-mediated signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9693
	76089
	ENSG00000109756
	ENSMUSG00000062232
	Q9Y4G8
	Q8CHG7
NM_014247; NM_001351724; NM_001351725; NM_001351726; NM_001351727;
	NM_001351728; NM_001394067
	NM_001099624; NM_001310536
NP_055062; NP_001338653; NP_001338654; NP_001338655; NP_001338656;
	NP_001338657
	NP_001093094; NP_001297465
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAPGEF2 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми^[3]. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 499 амінокислот, а молекулярна маса — 167 417^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKPLAIPANH	GVMGQQEKHS	LPADFTKLHL	TDSLHPQVTH	VSSSHSGCSI
TSDSGSSSLS	DIYQATESEA	GDMDLSGLPE	TAVDSEDDDD	EEDIERASDP
LMSRDIVRDC	LEKDPIDRTD	DDIEQLLEFM	HQLPAFANMT	MSVRRELCAV
MVFAVVERAG	TIVLNDGEEL	DSWSVILNGS	VEVTYPDGKA	EILCMGNSFG
VSPTMDKEYM	KGVMRTKVDD	CQFVCIAQQD	YCRILNQVEK	NMQKVEEEGE
IVMVKEHREL	DRTGTRKGHI	VIKGTSERLT	MHLVEEHSVV	DPTFIEDFLL
TYRTFLSSPM	EVGKKLLEWF	NDPSLRDKVT	RVVLLWVNNH	FNDFEGDPAM
TRFLEEFENN	LEREKMGGHL	RLLNIACAAK	AKRRLMTLTK	PSREAPLPFI
LLGGSEKGFG	IFVDSVDSGS	KATEAGLKRG	DQILEVNGQN	FENIQLSKAM
EILRNNTHLS	ITVKTNLFVF	KELLTRLSEE	KRNGAPHLPK	IGDIKKASRY
SIPDLAVDVE	QVIGLEKVNK	KSKANTVGGR	NKLKKILDKT	RISILPQKPY
NDIGIGQSQD	DSIVGLRQTK	HIPTALPVSG	TLSSSNPDLL	QSHHRILDFS
ATPDLPDQVL	RVFKADQQSR	YIMISKDTTA	KEVVIQAIRE	FAVTATPDQY
SLCEVSVTPE	GVIKQRRLPD	QLSKLADRIQ	LSGRYYLKNN	METETLCSDE
DAQELLRESQ	ISLLQLSTVE	VATQLSMRNF	ELFRNIEPTE	YIDDLFKLRS
KTSCANLKRF	EEVINQETFW	VASEILRETN	QLKRMKIIKH	FIKIALHCRE
CKNFNSMFAI	ISGLNLAPVA	RLRTTWEKLP	NKYEKLFQDL	QDLFDPSRNM
AKYRNVLNSQ	NLQPPIIPLF	PVIKKDLTFL	HEGNDSKVDG	LVNFEKLRMI
AKEIRHVGRM	ASVNMDPALM	FRTRKKKWRS	LGSLSQGSTN	ATVLDVAQTG
GHKKRVRRSS	FLNAKKLYED	AQMARKVKQY	LSNLELEMDE	ESLQTLSLQC
EPATNTLPKN	PGDKKPVKSE	TSPVAPRAGS	QQKAQSLPQP	QQQPPPAHKI
NQGLQVPAVS	LYPSRKKVPV	KDLPPFGINS	PQALKKILSL	SEEGSLERHK
KQAEDTISNA	SSQLSSPPTS	PQSSPRKGYT	LAPSGTVDNF	SDSGHSEISS
RSSIVSNSSF	DSVPVSLHDE	RRQRHSVSIV	ETNLGMGRME	RRTMIEPDQY
SLGSYAPMSE	GRGLYATATV	ISSPSTEELS	QDQGDRASLD	AADSGRGSWT
SCSSGSHDNI	QTIQHQRSWE	TLPFGHTHFD	YSGDPAGLWA	SSSHMDQIMF
SDHSTKYNRQ	NQSRESLEQA	QSRASWASST	GYWGEDSEGD	TGTIKRRGGK
DVSIEAESSS	LTSVTTEETK	PVPMPAHIAV	ASSTTKGLIA	RKEGRYREPP
PTPPGYIGIP	ITDFPEGHSH	PARKPPDYNV	ALQRSRMVAR	SSDTAGPSSV
QQPHGHPTSS	RPVNKPQWHK	PNESDPRLAP	YQSQGFSTEE	DEDEQVSAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, ендосомах.

Література

Mino A., Ohtsuka T., Inoue E., Takai Y. (2000). Membrane-associated guanylate kinase with inverted orientation (MAGI)-1/brain angiogenesis inhibitor 1-associated protein (BAP1) as a scaffolding molecule for Rap small G protein GDP/GTP exchange protein at tight junctions. Genes Cells. 5: 1009—1016. PMID 11168587 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00385.x
Rebhun J.F., Castro A.F., Quilliam L.A. (2000). Identification of guanine nucleotide exchange factors (GEFs) for the Rap1 GTPase. Regulation of MR-GEF by M-Ras-GTP interaction. J. Biol. Chem. 275: 34901—34908. PMID 10934204 DOI:10.1074/jbc.M005327200
Pham N., Rotin D. (2001). Nedd4 regulates ubiquitination and stability of the guanine-nucleotide exchange factor CNrasGEF. J. Biol. Chem. 276: 46995—47003. PMID 11598133 DOI:10.1074/jbc.M108373200
Pak Y., Pham N., Rotin D. (2002). Direct binding of the beta1 adrenergic receptor to the cyclic AMP-dependent guanine nucleotide exchange factor CNrasGEF leads to Ras activation. Mol. Cell. Biol. 22: 7942—7952. PMID 12391161 DOI:10.1128/MCB.22.22.7942-7952.2002
Amsen E.M., Pham N., Pak Y., Rotin D. (2006). The guanine nucleotide exchange factor CNrasGEF regulates melanogenesis and cell survival in melanoma cells. J. Biol. Chem. 281: 121—128. PMID 16272156 DOI:10.1074/jbc.M507595200
Emery A.C., Eiden M.V., Mustafa T., Eiden L.E. (2013). Rapgef2 Connects GPCR-Mediated cAMP Signals to ERK Activation in Neuronal and Endocrine Cells. Sci. Signal. 6: RA51—RA51. PMID 23800469 DOI:10.1126/scisignal.2003993

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16854 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4G8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16854 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y4G8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

RAPGEF2

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук