RAPGEF6

RAPGEF6
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D93, 3LNY
Ідентифікатори
Символи	RAPGEF6, KIA001LB, PDZ-GEF2, PDZGEF2, RA-GEF-2, RAGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 610499 MGI: 2384761 HomoloGene: 22968 GeneCards: RAPGEF6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidic acid binding; • GTP-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • guanyl-nucleotide exchange factor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • endocytic vesicle; • apical plasma membrane; • мембрана; • центросома;
Біологічний процес	• GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity; • small GTPase mediated signal transduction; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • Ras protein signal transduction; • microvillus assembly; • protein localization to plasma membrane; • establishment of endothelial intestinal barrier; • GO:0072468 сигнальна трансдукція;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51735
	192786
	ENSG00000158987
	ENSMUSG00000037533
	Q8TEU7
	н/д
NM_016340; NM_001164386; NM_001164387; NM_001164388; NM_001164389;
	NM_001164390
	NM_001252494; NM_001252496; NM_001252497; NM_001252498; NM_175258
NP_001157858; NP_001157859; NP_001157860; NP_001157861; NP_001157862;
	NP_057424
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAPGEF6 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 601 амінокислот, а молекулярна маса — 179 423^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSPVDPGAR	QALRKKPPER	TPEDLNTIYS	YLHGMEILSN	LREHQLRLMS
ARARYERYSG	NQVLFCSETI	ARCWYILLSG	SVLVKGSMVL	PPCSFGKQFG
GKRGCDCLVL	EPSEMIVVEN	AKDNEDSILQ	REIPARQSRR	RFRKINYKGE
RQTITDDVEV	NSYLSLPADL	TKMHLTENPH	PQVTHVSSSQ	SGCSIASDSG
SSSLSDIYQA	TESEVGDVDL	TRLPEGPVDS	EDDEEEDEEI	DRTDPLQGRD
LVRECLEKEP	ADKTDDDIEQ	LLEFMHQLPA	FANMTMSVRR	ELCSVMIFEV
VEQAGAIILE	DGQELDSWYV	ILNGTVEISH	PDGKVENLFM	GNSFGITPTL
DKQYMHGIVR	TKVDDCQFVC	IAQQDYWRIL	NHVEKNTHKV	EEEGEIVMVH
EHRELDRSGT	RKGHIVIKAT	PERLIMHLIE	EHSIVDPTYI	EDFLLTYRTF
LESPLDVGIK	LLEWFKIDSL	RDKVTRIVLL	WVNNHFNDFE	GDPAMTRFLE
EFEKNLEDTK	MNGHLRLLNI	ACAAKAKWRQ	VVLQKASRES	PLQFSLNGGS
EKGFGIFVEG	VEPGSKAADS	GLKRGDQIME	VNGQNFENIT	FMKAVEILRN
NTHLALTVKT	NIFVFKELLF	RTEQEKSGVP	HIPKIAEKKS	NRHSIQHVPG
DIEQTSQEKG	SKKVKANTVS	GGRNKIRKIL	DKTRFSILPP	KLFSDGGLSQ
SQDDSIVGTR	HCRHSLAIMP	IPGTLSSSSP	DLLQPTTSML	DFSNPSDIPD
QVIRVFKVDQ	QSCYIIISKD	TTAKEVVFHA	VHEFGLTGAS	DTYSLCEVSV
TPEGVIKQRR	LPDQFSKLAD	RIQLNGRYYL	KNNMETETLC	SDEDAQELVK
ESQLSMLQLS	TIEVATQLSM	RDFDLFRNIE	PTEYIDDLFK	LNSKTGNTHL
KRFEDIVNQE	TFWVASEILT	EANQLKRMKI	IKHFIKIALH	CRECKNFNSM
FAIISGLNLA	SVARLRGTWE	KLPSKYEKHL	QDLQDIFDPS	RNMAKYRNIL
SSQSMQPPII	PLFPVVKKDM	TFLHEGNDSK	VDGLVNFEKL	RMISKEIRQV
VRMTSANMDP	AMMFRQRSLS	QGSTNSNMLD	VQGGAHKKRA	RRSSLLNAKK
LYEDAQMARK	VKQYLSSLDV	ETDEEKFQMM	SLQWEPAYGT	LTKNLSEKRS
AKSSEMSPVP	MRSAGQTTKA	HLHQPHRVSQ	VLQVPAVNLH	PIRKKGQTKD
PALNTSLPQK	VLGTTEEISG	KKHTEDTISV	ASSLHSSPPA	SPQGSPHKGY
TLIPSAKSDN	LSDSSHSEIS	SRSSIVSNCS	VDSMSAALQD	ERCSSQALAV
PESTGALEKT	EHASGIGDHS	QHGPGWTLLK	PSLIKCLAVS	SSVSNEEISQ
EHIIIEAADS	GRGSWTSCSS	SSHDNFQSLP	NPKSWDFLNS	YRHTHLDDPI
AEVEPTDSEP	YSCSKSCSRT	CGQCKGSLER	KSWTSSSSLS	DTYEPNYGTV
KQRVLESTPA	ESSEGLDPKD	ATDPVYKTVT	SSTEKGLIVY	CVTSPKKDDR
YREPPPTPPG	YLGISLADLK	EGPHTHLKPP	DYSVAVQRSK	MMHNSLSRLP
PASLSSNLVA	CVPSKIVTQP	QRHNLQPFHP	KLGDVTDADS	EADENEQVSA
V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20655 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8TEU7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20655 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8TEU7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]