RASGEF1B

RASGEF1B
Ідентифікатори
Символи	RASGEF1B, GPIG4, RasGEF domain family member 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 614532 MGI: 2443755 HomoloGene: 14860 GeneCards: RASGEF1B
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • ендосома • late endosome • midbody • early endosome Біологічний процес • small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	153020	320292
Ensembl	ENSG00000138670	ENSMUSG00000089809
UniProt	Q0VAM2	Q8JZL7
RefSeq (мРНК)	NM_001300735 NM_001300736 NM_152545	NM_145839 NM_181318
RefSeq (білок)	NP_001287664 NP_001287665 NP_689758	NP_665838 NP_851835
Локус (UCSC)	Хр. 4: 81.43 – 82.04 Mb	Хр. 5: 99.37 – 99.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RASGEF1B (англ. RasGEF domain family member 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 55 359.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPQTPPFSAM		FDSSGYNRNL		YQSAEDSCGG		LYYHDNNLLS		GSLEALIQHL
VPNVDYYPDR		TYIFTFLLSS		RLFMHPYELM		AKVCHLCVEH		QRLSDPDSDK
NQMRKIAPKI		LQLLTEWTET		FPYDFRDERM		MRNLKDLAHR		IASGEEQTYR
KNVQQMMQCL		IRKLAALSQY		EEVLAKISST		STDRLTVLKT		KPQSIQRDII
TVCNDPYTLA		QQLTHIELER		LNYIGPEEFV		QAFVQKDPLD		NDKSCYSERK
KTRNLEAYVE		WFNRLSYLVA		TEICMPVKKK		HRARMIEYFI		DVARECFNIG
NFNSLMAIIS		GMNMSPVSRL		KKTWAKVKTA		KFDILEHQMD		PSSNFYNYRT
ALRGAAQRSL		TAHSSREKIV		IPFFSLLIKD		IYFLNEGCAN		RLPNGHVNFE
KFWELAKQVS		EFMTWKQVEC		PFERDRKILQ		YLLTVPVFSE		DALYLASYES
EGPENHIEKD		RWKSLRSSLL		GRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Yaman E., Gasper R., Koerner C., Wittinghofer A., Tazebay U.H. (2009). RasGEF1A and RasGEF1B are guanine nucleotide exchange factors that discriminate between Rap GTP-binding proteins and mediate Rap2-specific nucleotide exchange. FEBS J. 276: 4607—4616. PMID 19645719 doi:10.1111/j.1742-4658.2009.07166.x

Див. також

• Хромосома 4