RBCK1

RBCK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CRC, 2LGY, 4DBG
Ідентифікатори
Символи	RBCK1, C20orf18, HOIL-1, HOIL1, PBMEI, RBCK2, RNF54, UBCE7IP3, XAP3, XAP4, ZRANB4, PGBM1, RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610924 MGI: 1344372 HomoloGene: 32448 GeneCards: RBCK1
Пов'язані генетичні захворювання
polyglucosan body myopathy 1 with or without immunodeficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • identical protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • LUBAC complex Біологічний процес • negative regulation of necroptotic process • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0022415 viral process • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • T cell receptor signaling pathway • protein linear polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10616	24105
Ensembl	ENSG00000125826	ENSMUSG00000027466
UniProt	Q9BYM8	Q9WUB0
RefSeq (мРНК)	NM_006462 NM_031227 NM_031228 NM_031229 NM_001323956 NM_001323958 NM_001323960	NM_001083921 NM_019705 NM_001355282
RefSeq (білок)	NP_001310885 NP_001310887 NP_001310889 NP_006453 NP_112506	NP_001077390 NP_062679 NP_001342211
Локус (UCSC)	Хр. 20: 0.41 – 0.43 Mb	Хр. 2: 152.16 – 152.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBCK1 (англ. RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 57 572.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEKTKKAEE		MALSLTRAVA		GGDEQVAMKC		AIWLAEQRVP		LSVQLKPEVS
PTQDIRLWVS		VEDAQMHTVT		IWLTVRPDMT		VASLKDMVFL		DYGFPPVLQQ
WVIGQRLARD		QETLHSHGVR		QNGDSAYLYL		LSARNTSLNP		QELQRERQLR
MLEDLGFKDL		TLQPRGPLEP		GPPKPGVPQE		PGRGQPDAVP		EPPPVGWQCP
GCTFINKPTR		PGCEMCCRAR		PEAYQVPASY		QPDEEERARL		AGEEEALRQY
QQRKQQQQEG		NYLQHVQLDQ		RSLVLNTEPA		ECPVCYSVLA		PGEAVVLREC
LHTFCRECLQ		GTIRNSQEAE		VSCPFIDNTY		SCSGKLLERE		IKALLTPEDY
QRFLDLGISI		AENRSAFSYH		CKTPDCKGWC		FFEDDVNEFT		CPVCFHVNCL
LCKAIHEQMN		CKEYQEDLAL		RAQNDVAARQ		TTEMLKVMLQ		QGEAMRCPQC
QIVVQKKDGC		DWIRCTVCHT		EICWVTKGPR		WGPGGPGDTS		GGCRCRVNGI
PCHPSCQNCH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Cong Y.-S., Yao Y.-L., Yang W.-M., Kuzhandaivelu N., Seto E. (1997). The hepatitis B virus X-associated protein, XAP3, is a protein kinase C-binding protein. J. Biol. Chem. 272: 16482—16489. PMID 9195957 DOI:10.1074/jbc.272.26.16482
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Beasley S.A., Safadi S.S., Barber K.R., Shaw G.S. (2012). Solution structure of the E3 ligase HOIL-1 Ubl domain. Protein Sci. 21: 1085—1092. PMID 22517668 DOI:10.1002/pro.2080

Див. також

• Хромосома 20