RBM10

RBM10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LXI, 2M2B, 2MXV, 2MXW
Ідентифікатори
Символи	RBM10, DXS8237E, GPATC9, GPATCH9, S1-1, TARPS, ZRANB5, RNA binding motif protein 10
Зовнішні ІД	OMIM: 300080 MGI: 2384310 HomoloGene: 31330 GeneCards: RBM10
Пов'язані генетичні захворювання
TARP syndrome, Рак нирки, колоректальний рак, adenocarcinoma of the lung, bladder carcinoma, Низько-диференційований рак щитоподібної залози, Холангіокарцинома, meningioma, астробластома, рак молочної залози, рак простати
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • miRNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність • negative regulation of cell population proliferation • regulation of smooth muscle cell apoptotic process • positive regulation of smooth muscle cell apoptotic process • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8241	236732
Ensembl	ENSG00000182872	ENSMUSG00000031060
UniProt	P98175 Q7Z3D7	Q99KG3
RefSeq (мРНК)	NM_001204466 NM_001204467 NM_001204468 NM_005676 NM_152856	NM_001167775 NM_001167776 NM_145627 NM_001358903 NM_001358904 NM_001358905
RefSeq (білок)	NP_001191395 NP_001191396 NP_001191397 NP_005667 NP_690595 NP_001191397.1	NP_001161247 NP_001161248 NP_663602 NP_001345832 NP_001345833 NP_001345834
Локус (UCSC)	Хр. X: 47.15 – 47.19 Mb	Хр. X: 20.48 – 20.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM10 (англ. RNA binding motif protein 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 103 533.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEYERRGGRG		DRTGRYGATD		RSQDDGGENR		SRDHDYRDMD		YRSYPREYGS
QEGKHDYDDS		SEEQSAEDSY		EASPGSETQR		RRRRRHRHSP		TGPPGFPRDG
DYRDQDYRTE		QGEEEEEEED		EEEEEKASNI		VMLRMLPQAA		TEDDIRGQLQ
SHGVQAREVR		LMRNKSSGQS		RGFAFVEFSH		LQDATRWMEA		NQHSLNILGQ
KVSMHYSDPK		PKINEDWLCN		KCGVQNFKRR		EKCFKCGVPK		SEAEQKLPLG
TRLDQQTLPL		GGRELSQGLL		PLPQPYQAQG		VLASQALSQG		SEPSSENAND
TIILRNLNPH		STMDSILGAL		APYAVLSSSN		VRVIKDKQTQ		LNRGFAFIQL
STIVEAAQLL		QILQALHPPL		TIDGKTINVE		FAKGSKRDMA		SNEGSRISAA
SVASTAIAAA		QWAISQASQG		GEGTWATSEE		PPVDYSYYQQ		DEGYGNSQGT
ESSLYAHGYL		KGTKGPGITG		TKGDPTGAGP		EASLEPGADS		VSMQAFSRAQ
PGAAPGIYQQ		SAEASSSQGT		AANSQSYTIM		SPAVLKSELQ		SPTHPSSALP
PATSPTAQES		YSQYPVPDVS		TYQYDETSGY		YYDPQTGLYY		DPNSQYYYNA
QSQQYLYWDG		ERRTYVPALE		QSADGHKETG		APSKEGKEKK		EKHKTKTAQQ
IAKDMERWAR		SLNKQKENFK		NSFQPISSLR		DDERRESATA		DAGYAILEKK
GALAERQHTS		MDLPKLASDD		RPSPPRGLVA		AYSGESDSEE		EQERGGPERE
EKLTDWQKLA		CLLCRRQFPS		KEALIRHQQL		SGLHKQNLEI		HRRAHLSENE
LEALEKNDME		QMKYRDRAAE		RREKYGIPEP		PEPKRRKYGG		ISTASVDFEQ
PTRDGLGSDN		IGSRMLQAMG		WKEGSGLGRK		KQGIVTPIEA		QTRVRGSGLG
ARGSSYGVTS		TESYKETLHK		TMVTRFNEAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902

Див. також

• Хромосома X