ROBO1

ROBO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EO9, 2V9Q, 2V9T, 4HLJ
Ідентифікатори
Символи	ROBO1, DUTT1, SAX3, roundabout guidance receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602430 MGI: 1274781 HomoloGene: 2206 GeneCards: ROBO1
Онтологія гена Молекулярна функція • LRR domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • axon guidance receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • cell projection • мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • аксон • клітинна мембрана • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane Біологічний процес • positive regulation of Rho protein signal transduction • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • диференціація клітин • negative regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • Roundabout signaling pathway • positive regulation of axonogenesis • нейробіологія розвитку • cell migration involved in sprouting angiogenesis • axon guidance • multicellular organism development • хемотаксис • heart development • адгезія клітин • negative regulation of cell migration • negative regulation of negative chemotaxis • axon midline choice point recognition • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • chemorepulsion involved in postnatal olfactory bulb interneuron migration • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of MAP kinase activity • positive regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • outflow tract septum morphogenesis • aortic valve morphogenesis • pulmonary valve morphogenesis • endocardial cushion formation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction • aorta development • ventricular septum morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6091	19876
Ensembl	ENSG00000169855	ENSMUSG00000022883
UniProt	Q9Y6N7	O89026
RefSeq (мРНК)	NM_001145845 NM_002941 NM_133631	NM_019413
RefSeq (білок)	NP_001139317 NP_002932 NP_598334	NP_062286
Локус (UCSC)	Хр. 3: 78.6 – 79.77 Mb	Хр. 16: 72.11 – 72.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ROBO1 (англ. Roundabout guidance receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 651 амінокислот, а молекулярна маса — 180 930.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKWKHVPFLV		MISLLSLSPN		HLFLAQLIPD		PEDVERGNDH		GTPIPTSDND
DNSLGYTGSR		LRQEDFPPRI		VEHPSDLIVS		KGEPATLNCK		AEGRPTPTIE
WYKGGERVET		DKDDPRSHRM		LLPSGSLFFL		RIVHGRKSRP		DEGVYVCVAR
NYLGEAVSHN		ASLEVAILRD		DFRQNPSDVM		VAVGEPAVME		CQPPRGHPEP
TISWKKDGSP		LDDKDERITI		RGGKLMITYT		RKSDAGKYVC		VGTNMVGERE
SEVAELTVLE		RPSFVKRPSN		LAVTVDDSAE		FKCEARGDPV		PTVRWRKDDG
ELPKSRYEIR		DDHTLKIRKV		TAGDMGSYTC		VAENMVGKAE		ASATLTVQEP
PHFVVKPRDQ		VVALGRTVTF		QCEATGNPQP		AIFWRREGSQ		NLLFSYQPPQ
SSSRFSVSQT		GDLTITNVQR		SDVGYYICQT		LNVAGSIITK		AYLEVTDVIA
DRPPPVIRQG		PVNQTVAVDG		TFVLSCVATG		SPVPTILWRK		DGVLVSTQDS
RIKQLENGVL		QIRYAKLGDT		GRYTCIASTP		SGEATWSAYI		EVQEFGVPVQ
PPRPTDPNLI		PSAPSKPEVT		DVSRNTVTLS		WQPNLNSGAT		PTSYIIEAFS
HASGSSWQTV		AENVKTETSA		IKGLKPNAIY		LFLVRAANAY		GISDPSQISD
PVKTQDVLPT		SQGVDHKQVQ		RELGNAVLHL		HNPTVLSSSS		IEVHWTVDQQ
SQYIQGYKIL		YRPSGANHGE		SDWLVFEVRT		PAKNSVVIPD		LRKGVNYEIK
ARPFFNEFQG		ADSEIKFAKT		LEEAPSAPPQ		GVTVSKNDGN		GTAILVSWQP
PPEDTQNGMV		QEYKVWCLGN		ETRYHINKTV		DGSTFSVVIP		FLVPGIRYSV
EVAASTGAGS		GVKSEPQFIQ		LDAHGNPVSP		EDQVSLAQQI		SDVVKQPAFI
AGIGAACWII		LMVFSIWLYR		HRKKRNGLTS		TYAGIRKVPS		FTFTPTVTYQ
RGGEAVSSGG		RPGLLNISEP		AAQPWLADTW		PNTGNNHNDC		SISCCTAGNG
NSDSNLTTYS		RPADCIANYN		NQLDNKQTNL		MLPESTVYGD		VDLSNKINEM
KTFNSPNLKD		GRFVNPSGQP		TPYATTQLIQ		SNLSNNMNNG		SGDSGEKHWK
PLGQQKQEVA		PVQYNIVEQN		KLNKDYRAND		TVPPTIPYNQ		SYDQNTGGSY
NSSDRGSSTS		GSQGHKKGAR		TPKVPKQGGM		NWADLLPPPP		AHPPPHSNSE
EYNISVDESY		DQEMPCPVPP		ARMYLQQDEL		EEEEDERGPT		PPVRGAASSP
AAVSYSHQST		ATLTPSPQEE		LQPMLQDCPE		ETGHMQHQPD		RRRQPVSPPP
PPRPISPPHT		YGYISGPLVS		DMDTDAPEEE		EDEADMEVAK		MQTRRLLLRG
LEQTPASSVG		DLESSVTGSM		INGWGSASEE		DNISSGRSSV		SSSDGSFFTD
ADFAQAVAAA		AEYAGLKVAR		RQMQDAAGRR		HFHASQCPRP		TSPVSTDSNM
SAAVMQKTRP		AKKLKHQPGH		LRRETYTDDL		PPPPVPPPAI		KSPTAQSKTQ
LEVRPVVVPK		LPSMDARTDR		SSDRKGSSYK		GREVLDGRQV		VDMRTNPGDP
REAQEQQNDG		KGRGNKAAKR		DLPPAKTHLI		QEDILPYCRP		TFPTSNNPRD
PSSSSSMSSR		GSGSRQREQA		NVGRRNIAEM		QVLGGYERGE		DNNEELEETE
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як хемотаксис, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Bashaw G.J., Kidd T., Murray D., Pawson T., Goodman C.S. (2000). Repulsive axon guidance: Abelson and Enabled play opposing roles downstream of the roundabout receptor. Cell. 101: 703—715. PMID 10892742 doi:10.1016/S0092-8674(00)80883-1

Див. також

• Хромосома 3