ROBO2

ROBO2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UEM, 1UJT, 2EDJ
Ідентифікатори
Символи	ROBO2, SAX3, roundabout guidance receptor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602431 MGI: 1890110 HomoloGene: 43188 GeneCards: ROBO2
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • axon guidance receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell surface • axolemma • екзосома • клітинна мембрана Біологічний процес • диференціація клітин • ureteric bud development • розвиток нирки • negative regulation of synapse assembly • Roundabout signaling pathway • positive regulation of axonogenesis • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • хемотаксис • central nervous system development • cellular response to hormone stimulus • olfactory bulb interneuron development • apoptotic process involved in luteolysis • negative regulation of negative chemotaxis • axon midline choice point recognition • metanephros development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • retinal ganglion cell axon guidance • brain development • spinal cord development • axon guidance • outflow tract septum morphogenesis • aortic valve morphogenesis • pulmonary valve morphogenesis • endocardial cushion formation • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction • aorta development • ventricular septum morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6092	268902
Ensembl	ENSG00000185008	ENSMUSG00000052516
UniProt	Q9HCK4	Q7TPD3
RefSeq (мРНК)	NM_001128929 NM_001290039 NM_001290040 NM_001290065 NM_002942 NM_001378190 NM_001378191 NM_001378192 NM_001378193 NM_001378194 NM_001378195 NM_001378196 NM_001378197 NM_001378198 NM_001378199 NM_001378200 NM_001378201 NM_001378202 NM_001378203 NM_001394212 NM_001394213 NM_001394214 NM_001395656 NM_001395657	NM_175549 NM_001358490 NM_001358491 NM_001358492 NM_001358493 NM_001358494
RefSeq (білок)	NP_001122401 NP_001276968 NP_001276969 NP_001276994 NP_002933 NP_001365119 NP_001365120 NP_001365121 NP_001365122 NP_001365123 NP_001365124 NP_001365125 NP_001365126 NP_001365127 NP_001365128 NP_001365129 NP_001365130 NP_001365131 NP_001365132	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 75.91 – 77.65 Mb	Хр. 16: 73.69 – 74.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ROBO2 (англ. Roundabout guidance receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 378 амінокислот, а молекулярна маса — 151 200.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLLMFTQLL		LCGFLYVRVD		GSRLRQEDFP		PRIVEHPSDV		IVSKGEPTTL
NCKAEGRPTP		TIEWYKDGER		VETDKDDPRS		HRMLLPSGSL		FFLRIVHGRR
SKPDEGSYVC		VARNYLGEAV		SRNASLEVAL		LRDDFRQNPT		DVVVAAGEPA
ILECQPPRGH		PEPTIYWKKD		KVRIDDKEER		ISIRGGKLMI		SNTRKSDAGM
YTCVGTNMVG		ERDSDPAELT		VFERPTFLRR		PINQVVLEEE		AVEFRCQVQG
DPQPTVRWKK		DDADLPRGRY		DIKDDYTLRI		KKTMSTDEGT		YMCIAENRVG
KMEASATLTV		RAPPQFVVRP		RDQIVAQGRT		VTFPCETKGN		PQPAVFWQKE
GSQNLLFPNQ		PQQPNSRCSV		SPTGDLTITN		IQRSDAGYYI		CQALTVAGSI
LAKAQLEVTD		VLTDRPPPII		LQGPANQTLA		VDGTALLKCK		ATGDPLPVIS
WLKEGFTFPG		RDPRATIQEQ		GTLQIKNLRI		SDTGTYTCVA		TSSSGETSWS
AVLDVTESGA		TISKNYDLSD		LPGPPSKPQV		TDVTKNSVTL		SWQPGTPGTL
PASAYIIEAF		SQSVSNSWQT		VANHVKTTLY		TVRGLRPNTI		YLFMVRAINP
QGLSDPSPMS		DPVRTQDISP		PAQGVDHRQV		QKELGDVLVR		LHNPVVLTPT
TVQVTWTVDR		QPQFIQGYRV		MYRQTSGLQA		TSSWQNLDAK		VPTERSAVLV
NLKKGVTYEI		KVRPYFNEFQ		GMDSESKTVR		TTEEAPSAPP		QSVTVLTVGS
YNSTSISVSW		DPPPPDHQNG		IIQEYKIWCL		GNETRFHINK		TVDAAIRSVI
IGGLFPGIQY		RVEVAASTSA		GVGVKSEPQP		IIIGRRNEVV		ITENNNSITE
QITDVVKQPA		FIAGIGGACW		VILMGFSIWL		YWRRKKRKGL		SNYAVTFQRG
DGGLMSNGSR		PGLLNAGDPS		YPWLADSWPA		TSLPVNNSNS		GPNEIGNFGR
GDVLPPVPGQ		GDKTATMLSD		GAIYSSIDFT		TKTSYNSSSQ		ITQATPYATT
QILHSNSIHE		LAVDLPDPQW		KSSIQQKTDL		MGFGYSLPDQ		NKGNNGGKGG
KKKKNKNSSK		PQKNNGSTWA		NVPLPPPPVQ		PLPGTELEHY		AVEQQENGYD
SDSWCPPLPV		QTYLHQGLED		ELEEDDDRVP		TPPVRGVASS		PAISFGQQST
ATLTPSPREE		MQPMLQAHLD		ELTRAYQFDI		AKQTWHIQSN		NQPPQPPVPP
LGYVSGALIS		DLETDVADDD		ADDEEEALEI		PRPLRALDQT		PGSSMDNLDS
SVTGKAFTSS		QRPRPTSPFS		TDSNTSAALS		QSQRPRPTKK		HKGGRMDQQP
ALPHRREGMT		DEEALVPYSK		PSFPSPGGHS		SSGTASSKGS		TGPRKTEVLR
AGHQRNASDL		LDIGYMGSNS		QGQFTGEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як хемотаксис, диференціація, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Yue Y., Grossmann B., Galetzka D., Zechner U., Haaf T. (2006). Isolation and differential expression of two isoforms of the ROBO2/Robo2 axon guidance receptor gene in humans and mice. Genomics. 88: 772—778. PMID 16829019 doi:10.1016/j.ygeno.2006.05.011
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3