RTKN

RTKN
Ідентифікатори
Символи	RTKN, rhotekin
Зовнішні ІД	OMIM: 602288 MGI: 107371 HomoloGene: 7522 GeneCards: RTKN
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GTPase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • компонент клітини • actomyosin contractile ring Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • regulation of apoptotic process • Rho protein signal transduction • septin cytoskeleton organization • mitotic cytokinesis • actomyosin contractile ring assembly • cortical cytoskeleton organization • septin ring organization • protein localization to mitotic actomyosin contractile ring Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6242	20166
Ensembl	ENSG00000114993	ENSMUSG00000034930
UniProt	Q9BST9	Q8C6B2
RefSeq (мРНК)	NM_001015055 NM_001015056 NM_033046	NM_001136227 NM_009106 NM_133641 NM_001355524 NM_001355525
RefSeq (білок)	NP_001015055 NP_001015056 NP_149035	NP_001129699 NP_033132 NP_598396 NP_001342453 NP_001342454
Локус (UCSC)	Хр. 2: 74.43 – 74.44 Mb	Хр. 6: 83.11 – 83.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RTKN (англ. Rhotekin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 62 667.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSRNHRSRV		TVARGSALEM		EFKRGRFRLS		LFSDLPEDTE		LQRKLDHEIR
MREGACKLLA		ACSQREQALE		ATKSLLVCNS		RILSYMGELQ		RRKEAQVLGK
TSRRPSDSGP		PAERSPCRGR		VCISDLRIPL		MWKDTEYFKN		KGDLHRWAVF
LLLQLGEHIQ		DTEMILVDRT		LTDISFQSNV		LFAEAGPDFE		LRLELYGACV
EEEGALTGGP		KRLATKLSSS		LGRSSGRRVR		ASLDSAGGSG		SSPILLPTPV
VGGPRYHLLA		HTTLTLAAVQ		DGFRTHDLTL		ASHEENPAWL		PLYGSVCCRL
AAQPLCMTQP		TASGTLRVQQ		AGEMQNWAQV		HGVLKGTNLF		CYRQPEDADT
GEEPLLTIAV		NKETRVRAGE		LDQALGRPFT		LSISNQYGDD		EVTHTLQTES
REALQSWMEA		LWQLFFDMSQ		WKQCCDEIMK		IETPAPRKPP		QALAKQGSLY
HEMAIEPLDD		IAAVTDILTQ		REGARLETPP		PWLAMFTDQP		ALPNPCSPAS
VAPAPDWTHP		LPWGRPRTFS		LDAVPPDHSP		RARSVAPLPP		QRSPRTRGLC
SKGQPRTWLQ		SPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ.

Література

• Reynaud C., Fabre S., Jalinot P. (2000). The PDZ protein TIP-1 interacts with the Rho effector rhotekin and is involved in Rho signaling to the serum response element. J. Biol. Chem. 275: 33962—33968. PMID 10940294 DOI:10.1074/jbc.M000465200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu C.-A., Wang M.-J., Chi C.-W., Wu C.-W., Chen J.-Y. (2004). Rho/Rhotekin-mediated NF-kappaB activation confers resistance to apoptosis. Oncogene. 23: 8731—8742. PMID 15480428 DOI:10.1038/sj.onc.1208106

Див. також

• Хромосома 2