S100A12

S100A12
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1E8A, 1GQM, 1ODB, 2M9G, 2WC8, 2WCB, 2WCE, 2WCF
Ідентифікатори
Символи	S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, S100 calcium binding protein A12, EN-RAGE
Зовнішні ІД	OMIM: 603112 HomoloGene: 48361 GeneCards: S100A12
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RAGE receptor binding • copper ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • цитоскелет • клітинне ядро • secretory granule lumen Біологічний процес • mast cell activation • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of MAP kinase activity • monocyte chemotaxis • процес імунної системи • defense response to fungus • neutrophil chemotaxis • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • xenobiotic metabolic process • вроджений імунітет • inflammatory response • neutrophil degranulation • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • killing of cells of other organism Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6283	н/д
Ensembl	ENSG00000163221	н/д
UniProt	P80511	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005621	н/д
RefSeq (білок)	NP_005612	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.37 – 153.38 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

S100A12 (англ. S100 calcium binding protein A12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 575.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKLEEHLEG		IVNIFHQYSV		RKGHFDTLSK		GELKQLLTKE		LANTIKNIKD
KAVIDEIFQG		LDANQDEQVD		FQEFISLVAI		ALKAAHYHTH		KE

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Wicki R., Marenholz I., Mischke D., Schaefer B.W., Heizmann C.W. (1996). Characterization of the human S100A12 (calgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) gene, a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21. Cell Calcium. 20: 459—464. PMID 8985590 DOI:10.1016/S0143-4160(96)90087-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454—458. PMID 8619876 DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
• Guignard F., Mauel J., Markert M. (1995). Identification and characterization of a novel human neutrophil protein related to the S100 family. Biochem. J. 309: 395—401. PMID 7626002 DOI:10.1042/bj3090395
• Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family. J. Biol. Chem. 277: 28848—28852. PMID 12042313 DOI:10.1074/jbc.M203602200
• Moroz O.V., Dodson G.G., Wilson K.S., Lukanidin E., Bronstein I.B. (2003). Multiple structural states of S100A12: A key to its functional diversity. Microsc. Res. Tech. 60: 581—592. PMID 12645006 DOI:10.1002/jemt.10300

Див. також

• Хромосома 1