SARM1

SARM1
Ідентифікатори
Символи	SARM1, MyD88-5, SAMD2, SARM, sterile alpha and TIR motif containing 1, hHsTIR
Зовнішні ІД	OMIM: 607732 MGI: 2136419 HomoloGene: 9015 GeneCards: SARM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling adaptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • microtubule cytoskeleton • синапс • extrinsic component of mitochondrial outer membrane • аксон • міжклітинні контакти • мітохондрія • мікротрубочка • дендрит (нейробіологія) Біологічний процес • regulation of apoptotic process • диференціація клітин • процес імунної системи • response to glucose • нейробіологія розвитку • regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of neuron death • positive regulation of signal transduction • response to axon injury Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23098	237868
Ensembl	ENSG00000004139	ENSMUSG00000050132
UniProt	Q6SZW1 Q0D2N8	Q6PDS3
RefSeq (мРНК)	NM_015077	NM_001168521 NM_172795
RefSeq (білок)	NP_055892 NP_055892.2	NP_001161993 NP_766383
Локус (UCSC)	Хр. 17: 28.36 – 28.4 Mb	Хр. 11: 78.36 – 78.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SARM1 (англ. Sterile alpha and TIR motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 724 амінокислот, а молекулярна маса — 79 388.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLTLLLSAY		KLCRFFAMSG		PRPGAERLAV		PGPDGGGGTG		PWWAAGGRGP
REVSPGAGTE		VQDALERALP		ELQQALSALK		QAGGARAVGA		GLAEVFQLVE
EAWLLPAVGR		EVAQGLCDAI		RLDGGLDLLL		RLLQAPELET		RVQAARLLEQ
ILVAENRDRV		ARIGLGVILN		LAKEREPVEL		ARSVAGILEH		MFKHSEETCQ
RLVAAGGLDA		VLYWCRRTDP		ALLRHCALAL		GNCALHGGQA		VQRRMVEKRA
AEWLFPLAFS		KEDELLRLHA		CLAVAVLATN		KEVEREVERS		GTLALVEPLV
ASLDPGRFAR		CLVDASDTSQ		GRGPDDLQRL		VPLLDSNRLE		AQCIGAFYLC
AEAAIKSLQG		KTKVFSDIGA		IQSLKRLVSY		STNGTKSALA		KRALRLLGEE
VPRPILPSVP		SWKEAEVQTW		LQQIGFSKYC		ESFREQQVDG		DLLLRLTEEE
LQTDLGMKSG		ITRKRFFREL		TELKTFANYS		TCDRSNLADW		LGSLDPRFRQ
YTYGLVSCGL		DRSLLHRVSE		QQLLEDCGIH		LGVHRARILT		AAREMLHSPL
PCTGGKPSGD		TPDVFISYRR		NSGSQLASLL		KVHLQLHGFS		VFIDVEKLEA
GKFEDKLIQS		VMGARNFVLV		LSPGALDKCM		QDHDCKDWVH		KEIVTALSCG
KNIVPIIDGF		EWPEPQVLPE		DMQAVLTFNG		IKWSHEYQEA		TIEKIIRFLQ
GRSSRDSSAG		SDTSLEGAAP		MGPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• Mink M., Fogelgren B., Olszewski K., Maroy P., Csiszar K. (2001). A novel human gene (SARM) at chromosome 17q11 encodes a protein with a SAM motif and structural similarity to Armadillo/beta-catenin that is conserved in mouse, Drosophila, and Caenorhabditis elegans. Genomics. 74: 234—244. PMID 11386760 doi:10.1006/geno.2001.6548
• O'Neill L.A.J. (2006). DisSARMing Toll-like receptor signaling. Nat. Immunol. 7: 1023—1025. PMID 16985498 doi:10.1038/ni1006-1023
• Dalod M. (2007). Studies of SARM1 uncover similarities between immune and neuronal responses to danger. Sci. STKE. 2007: PE73—PE73. PMID 18089857 doi:10.1126/stke.4172007pe73
• Panneerselvam P., Singh L.P., Ho B., Chen J., Ding J.L. (2012). Targeting of pro-apoptotic TLR adaptor SARM to mitochondria: definition of the critical region and residues in the signal sequence. Biochem. J. 442: 263—271. PMID 22145856 doi:10.1042/BJ20111653

Див. також

• Хромосома 17