SCNM1

SCNM1
Ідентифікатори
Символи	SCNM1, sodium channel modifier 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608095 MGI: 1341284 HomoloGene: 11431 GeneCards: SCNM1
Онтологія гена Молекулярна функція • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA processing • Сплайсинг РНК • Альтернативний сплайсинг Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79005	69269
Ensembl	ENSG00000163156	ENSMUSG00000092607
UniProt	Q9BWG6	Q8K136
RefSeq (мРНК)	NM_001002234 NM_001204856 NM_024041	NM_001163573 NM_027013
RefSeq (білок)	NP_001191777	NP_001157045 NP_081289 NP_001393401 NP_001393402 NP_001393403 NP_001393404 NP_001393405 NP_001393415
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.16 – 151.17 Mb	Хр. 3: 95.04 – 95.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCNM1 (англ. Sodium channel modifier 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 230 амінокислот, а молекулярна маса — 25 949.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFKREGDDW		SQLNVLKKRR		VGDLLASYIP		EDEALMLRDG		RFACAICPHR
PVLDTLAMLT		AHRAGKKHLS		SLQLFYGKKQ		PGKERKQNPK		HQNELRREET
KAEAPLLTQT		RLITQSALHR		APHYNSCCRR		KYRPEAPGPS		VSLSPMPPSE
VKLQSGKISR		EPEPAAGPQA		EESATVSAPA		PMSPTRRRAL		DHYLTLRSSG
WIPDGRGRWV		KDENVEFDSD		EEEPPDLPLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1