SEMA5B

SEMA5B
Ідентифікатори
Символи	SEMA5B, SEMAG, SemG, semaphorin 5B
Зовнішні ІД	OMIM: 609298 MGI: 107555 HomoloGene: 8427 GeneCards: SEMA5B
Пов'язані генетичні захворювання
рак стравоходу
Онтологія гена Молекулярна функція • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • axon extension • detection of light stimulus involved in visual perception • neuron projection guidance • multicellular organism development • neuron projection extension • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54437	20357
Ensembl	ENSG00000082684	ENSMUSG00000052133
UniProt	Q9P283	Q60519
RefSeq (мРНК)	NM_001031702 NM_001256346 NM_001256347 NM_001256348 NM_018987	NM_013661
RefSeq (білок)	NP_001026872 NP_001243275 NP_001243276 NP_001243277	NP_038689
Локус (UCSC)	Хр. 3: 122.91 – 123.03 Mb	Хр. 16: 35.36 – 35.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEMA5B (англ. Semaphorin 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 151 амінокислот, а молекулярна маса — 125 913.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPCGFSPSPV		AHHLVPGPPD		TPAQQLRCGW		TVGGWLLSLV		RGLLPCLPPG
ARTAEGPIMV		LAGPLAVSLL		LPSLTLLVSH		LSSSQDVSSE		PSSEQQLCAL
SKHPTVAFED		LQPWVSNFTY		PGARDFSQLA		LDPSGNQLIV		GARNYLFRLS
LANVSLLQAT		EWASSEDTRR		SCQSKGKTEE		ECQNYVRVLI		VAGRKVFMCG
TNAFSPMCTS		RQVGNLSRTI		EKINGVARCP		YDPRHNSTAV		ISSQGELYAA
TVIDFSGRDP		AIYRSLGSGP		PLRTAQYNSK		WLNEPNFVAA		YDIGLFAYFF
LRENAVEHDC		GRTVYSRVAR		VCKNDVGGRF		LLEDTWTTFM		KARLNCSRPG
EVPFYYNELQ		SAFHLPEQDL		IYGVFTTNVN		SIAASAVCAF		NLSAISQAFN
GPFRYQENPR		AAWLPIANPI		PNFQCGTLPE		TGPNENLTER		SLQDAQRLFL
MSEAVQPVTP		EPCVTQDSVR		FSHLVVDLVQ		AKDTLYHVLY		IGTESGTILK
ALSTASRSLH		GCYLEELHVL		PPGRREPLRS		LRILHSARAL		FVGLRDGVLR
VPLERCAAYR		SQGACLGARD		PYCGWDGKQQ		RCSTLEDSSN		MSLWTQNITA
CPVRNVTRDG		GFGPWSPWQP		CEHLDGDNSG		SCLCRARSCD		SPRPRCGGLD
CLGPAIHIAN		CSRNGAWTPW		SSWALCSTSC		GIGFQVRQRS		CSNPAPRHGG
RICVGKSREE		RFCNENTPCP		VPIFWASWGS		WSKCSSNCGG		GMQSRRRACE
NGNSCLGCGV		EFKTCNPEGC		PEVRRNTPWT		PWLPVNVTQG		GARQEQRFRF
TCRAPLADPH		GLQFGRRRTE		TRTCPADGSG		SCDTDALVEV		LLRSGSTSPH
TVSGGWAAWG		PWSSCSRDCE		LGFRVRKRTC		TNPEPRNGGL		PCVGDAAEYQ
DCNPQACPVR		GAWSCWTSWS		PCSASCGGGH		YQRTRSCTSP		APSPGEDICL
GLHTEEALCA		TQACPEGWSP		WSEWSKCTDD		GAQSRSRHCE		ELLPGSSACA
GNSSQSRPCP		YSEIPVILPA		SSMEEATDCA		GFNLIHLVAT		GISCFLGSGL
LTLAVYLSCQ		HCQRQSQEST		LVHPATPNHL		HYKGGGTPKN		EKYTPMEFKT
LNKNNLIPDD		RANFYPLQQT		NVYTTTYYPS		PLNKHSFRPE		ASPGQRCFPN
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3