SEPSECS

SEPSECS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3HL2, 4ZDO, 4ZDL, 4ZDP
Ідентифікатори
Символи	SEPSECS, LP, PCH2D, SLA, SLA/LP, Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase, soluble liver antigen, SecS
Зовнішні ІД	OMIM: 613009 MGI: 1098791 HomoloGene: 15031 GeneCards: SEPSECS
Пов'язані генетичні захворювання
pontocerebellar hypoplasia type 2D, pontocerebellar hypoplasia type 2
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • tRNA binding • selenotransferase activity • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • phosphoseryl-selenocysteinyl-tRNA selenium transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • selenocysteine incorporation • Біосинтез білків • selenocysteine metabolic process • selenocysteinyl-tRNA(Sec) biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51091	211006
Ensembl	ENSG00000109618	ENSMUSG00000029173
UniProt	Q9HD40	Q6P6M7
RefSeq (мРНК)	NM_001159728 NM_016955	NM_172490 NM_001363463
RefSeq (білок)	NP_058651	NP_766078 NP_001350392
Локус (UCSC)	Хр. 4: 25.12 – 25.16 Mb	Хр. 5: 52.8 – 52.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEPSECS (англ. Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 55 726.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNRESFAAGE		RLVSPAYVRQ		GCEARRSHEH		LIRLLLEKGK		CPENGWDEST
LELFLHELAI		MDSNNFLGNC		GVGEREGRVA		SALVARRHYR		FIHGIGRSGD
ISAVQPKAAG		SSLLNKITNS		LVLDIIKLAG		VHTVANCFVV		PMATGMSLTL
CFLTLRHKRP		KAKYIIWPRI		DQKSCFKSMI		TAGFEPVVIE		NVLEGDELRT
DLKAVEAKVQ		ELGPDCILCI		HSTTSCFAPR		VPDRLEELAV		ICANYDIPHI
VNNAYGVQSS		KCMHLIQQGA		RVGRIDAFVQ		SLDKNFMVPV		GGAIIAGFND
SFIQEISKMY		PGRASASPSL		DVLITLLSLG		SNGYKKLLKE		RKEMFSYLSN
QIKKLSEAYN		ERLLHTPHNP		ISLAMTLKTL		DEHRDKAVTQ		LGSMLFTRQV
SGARVVPLGS		MQTVSGYTFR		GFMSHTNNYP		CAYLNAASAI		GMKMQDVDLF
IKRLDRCLKA		VRKERSKESD		DNYDKTEDVD		IEEMALKLDN		VLLDTYQDAS
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, піридоксаль-фосфатом, тРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Costa M., Rodriguez-Sanchez J.L., Czaja A.J., Gelpi C. (2000). Isolation and characterization of cDNA encoding the antigenic protein of the human tRNP(Ser)Sec complex recognized by autoantibodies from patients withtype-1 autoimmune hepatitis. Clin. Exp. Immunol. 121: 364—374. PMID 10931155 doi:10.1046/j.1365-2249.2000.01280.x
• Palioura S., Sherrer R.L., Steitz T.A., Soll D., Simonovic M. (2009). The human SepSecS-tRNASec complex reveals the mechanism of selenocysteine formation. Science. 325: 321—325. PMID 19608919 doi:10.1126/science.1173755

Див. також

• Хромосома 4