SERINC5

SERINC5
Ідентифікатори
Символи	SERINC5, C5orf12, TPO1, serine incorporator 5, chromosome 5 open reading frame 12, AIGP3, C86123, A130038L21Rik
Зовнішні ІД	OMIM: 614551 MGI: 2444223 HomoloGene: 65246 GeneCards: SERINC5
Онтологія гена Молекулярна функція • L-serine transmembrane transporter activity Клітинна компонента • екзосома • комплекс Ґольджі • myelin sheath • мембрана • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • клітинна мембрана • integral component of membrane Біологічний процес • phospholipid biosynthetic process • вроджений імунітет • L-serine transport • positive regulation of serine C-palmitoyltransferase activity • phosphatidylserine metabolic process • detection of virus • процес імунної системи • myelination • GO:0022415 viral process • lipid metabolism • positive regulation of CDP-diacylglycerol-serine O-phosphatidyltransferase activity • defense response to virus • sphingolipid metabolic process • L-serine biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	256987	218442
Ensembl	ENSG00000164300	ENSMUSG00000021703
UniProt	Q86VE9	Q8BHJ6
RefSeq (мРНК)	NM_001174071 NM_001174072 NM_178276	NM_172588
RefSeq (білок)	NP_001167542 NP_001167543 NP_840060	NP_766176
Локус (UCSC)	Хр. 5: 80.11 – 80.26 Mb	Хр. 13: 92.75 – 92.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SERINC5 (англ. Serine incorporator 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 47 009.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAQCCAGQL		ACCCGSAGCS		LCCDCCPRIR		QSLSTRFMYA		LYFILVVVLC
CIMMSTTVAH		KMKEHIPFFE		DMCKGIKAGD		TCEKLVGYSA		VYRVCFGMAC
FFFIFCLLTL		KINNSKSCRA		HIHNGFWFFK		LLLLGAMCSG		AFFIPDQDTF
LNAWRYVGAV		GGFLFIGIQL		LLLVEFAHKW		NKNWTAGTAS		NKLWYASLAL
VTLIMYSIAT		GGLVLMAVFY		TQKDSCMENK		ILLGVNGGLC		LLISLVAISP
WVQNRQPHSG		LLQSGVISCY		VTYLTFSALS		SKPAEVVLDE		HGKNVTICVP
DFGQDLYRDE		NLVTILGTSL		LIGCILYSCL		TSTTRSSSDA		LQGRYAAPEL
EIARCCFCFS		PGGEDTEEQQ		PGKEGPRVIY		DEKKGTVYIY		SYFHFVFFLA
SLYVMMTVTN		WFNHVRSAFH		LLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, метаболізм ліпідів, біосинтез ліпідів, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Usami Y., Wu Y., Goettlinger H.G. (2015). SERINC3 and SERINC5 restrict HIV-1 infectivity and are counteracted by Nef. Nature. 526: 218—223. PMID 26416733 DOI:10.1038/nature15400

Див. також

• Хромосома 5