SH3BP4

SH3BP4
Ідентифікатори
Символи	SH3BP4, BOG25, TTP, SH3 domain binding protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605611 MGI: 2138297 HomoloGene: 8726 GeneCards: SH3BP4
Пов'язані генетичні захворювання
Розщеплення піднебіння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GDP-dissociation inhibitor activity Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • clathrin-coated pit • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • екзосома • клітинне ядро • clathrin-coated vesicle Біологічний процес • cellular response to amino acid stimulus • protein localization to lysosome • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • GO:0048552 regulation of catalytic activity • ендоцитоз • negative regulation of cell growth • positive regulation of autophagy • amino acid import • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of TOR signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23677	98402
Ensembl	ENSG00000130147	ENSMUSG00000036206
UniProt	Q9P0V3	Q921I6
RefSeq (мРНК)	NM_014521	NM_133816
RefSeq (білок)	NP_055336 NP_001358231 NP_001358232 NP_001358233 NP_001358234 NP_001358235	NP_598577
Локус (UCSC)	Хр. 2: 234.95 – 235.06 Mb	Хр. 1: 89 – 89.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SH3BP4 (англ. SH3 domain binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 107 496.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAQRIRAAN		SNGLPRCKSE		GTLIDLSEGF		SETSFNDIKV		PSPSALLVDN
PTPFGNAKEV		IAIKDYCPTN		FTTLKFSKGD		HLYVLDTSGG		EWWYAHNTTE
MGYIPSSYVQ		PLNYRNSTLS		DSGMIDNLPD		SPDEVAKELE		LLGGWTDDKK
VPGRMYSNNP		FWNGVQTNPF		LNGNVPVMPS		LDELNPKSTV		DLLLFDAGTS
SFTESSSATT		NSTGNIFDEL		PVTNGLHAEP		PVRRDNPFFR		SKRSYSLSEL
SVLQAKSDAP		TSSSFFTGLK		SPAPEQFQSR		EDFRTAWLNH		RKLARSCHDL
DLLGQSPGWG		QTQAVETNIV		CKLDSSGGAV		QLPDTSISIH		VPEGHVAPGE
TQQISMKALL		DPPLELNSDR		SCSISPVLEV		KLSNLEVKTS		IILEMKVSAE
IKNDLFSKST		VGLQCLRSDS		KEGPYVSVPL		NCSCGDTVQA		QLHNLEPCMY
VAVVAHGPSI		LYPSTVWDFI		NKKVTVGLYG		PKHIHPSFKT		VVTIFGHDCA
PKTLLVSEVT		RQAPNPAPVA		LQLWGKHQFV		LSRPQDLKVC		MFSNMTNYEV
KASEQAKVVR		GFQLKLGKVS		RLIFPITSQN		PNELSDFTLR		VQVKDDQEAI
LTQFCVQTPQ		PPPKSAIKPS		GQRRFLKKNE		VGKIILSPFA		TTTKYPTFQD
RPVSSLKFGK		LLKTVVRQNK		NHYLLEYKKG		DGIALLSEER		VRLRGQLWTK
EWYIGYYQGR		VGLVHTKNVL		VVGRARPSLC		SGPELSTSVL		LEQILRPCKF
LTYIYASVRT		LLMENISSWR		SFADALGYVN		LPLTFFCRAE		LDSEPERVAS
VLEKLKEDCN		NTENKERKSF		QKELVMALLK		MDCQGLVVRL		IQDFVLLTTA
VEVAQRWREL		AEKLAKVSKQ		QMDAYESPHR		DRNGVVDSEA		MWKPAYDFLL
TWSHQIGDSY		RDVIQELHLG		LDKMKNPITK		RWKHLTGTLI		LVNSLDVLRA
AAFSPADQDD		FVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ендоцитоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Dunlevy J.R., Berryhill B.L., Vergnes J.-P., SundarRaj N., Hassell J.R. (1999). Cloning, chromosomal localization, and characterization of cDNA from a novel gene, SH3BP4, expressed by human corneal fibroblasts. Genomics. 62: 519—524. PMID 10644451 doi:10.1006/geno.1999.5994
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Khanobdee K., Kolberg J.B., Dunlevy J.R. (2004). Nuclear and plasma membrane localization of SH3BP4 in retinal pigment epithelial cells. Mol. Vis. 10: 933—942. PMID 15616480

Див. також

• Хромосома 2