SMYD1

SMYD1
Ідентифікатори
Символи	SMYD1, BOP, KMT3D, ZMYND18, ZMYND22, SET and MYND domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606846 MGI: 104790 HomoloGene: 7645 GeneCards: SMYD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone-lysine N-methyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • Метилювання • positive regulation of myoblast differentiation • ремоделювання хроматину • transcription, DNA-templated • skeletal muscle cell differentiation • heart development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone lysine methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of myotube differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	150572	12180
Ensembl	ENSG00000115593	ENSMUSG00000055027
UniProt	Q8NB12	P97443
RefSeq (мРНК)	NM_198274 NM_001330364	NM_001160127 NM_009762
RefSeq (білок)	NP_001317293 NP_938015	NP_001153599 NP_033892
Локус (UCSC)	Хр. 2: 88.07 – 88.11 Mb	Хр. 6: 71.19 – 71.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMYD1 (англ. SET and MYND domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 56 617.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTIGRMENVE		VFTAEGKGRG		LKATKEFWAA		DIIFAERAYS		AVVFDSLVNF
VCHTCFKRQE		KLHRCGQCKF		AHYCDRTCQK		DAWLNHKNEC		SAIKRYGKVP
NENIRLAARI		MWRVEREGTG		LTEGCLVSVD		DLQNHVEHFG		EEEQKDLRVD
VDTFLQYWPP		QSQQFSMQYI		SHIFGVINCN		GFTLSDQRGL		QAVGVGIFPN
LGLVNHDCWP		NCTVIFNNGN		HEAVKSMFHT		QMRIELRALG		KISEGEELTV
SYIDFLNVSE		ERKRQLKKQY		YFDCTCEHCQ		KKLKDDLFLG		VKDNPKPSQE
VVKEMIQFSK		DTLEKIDKAR		SEGLYHEVVK		LCRECLEKQE		PVFADTNIYM
LRMLSIVSEV		LSYLQAFEEA		SFYARRMVDG		YMKLYHPNNA		QLGMAVMRAG
LTNWHAGNIE		VGHGMICKAY		AILLVTHGPS		HPITKDLEAM		RVQTEMELRM
FRQNEFMYYK		MREAALNNQP		MQVMAEPSNE		PSPALFHKKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2