SMYD2

SMYD2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3RIB, 3S7B, 3S7D, 3S7F, 3S7J, 3TG4, 3TG5, 4O6F, 4WUY, 4YND, 5ARF, 5ARG
Ідентифікатори
Символи	SMYD2, HSKM-B, KMT3C, ZMYND14, SET and MYND domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610663 MGI: 1915889 HomoloGene: 32466 GeneCards: SMYD2
шифр КФ	2.1.1.354
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • RNA polymerase II complex binding • p53 binding • зв'язування з іоном металу • protein-lysine N-methyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone methyltransferase activity (H3-K36 specific) • lysine N-methyltransferase activity • histone-lysine N-methyltransferase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • peptidyl-lysine monomethylation • transcription, DNA-templated • histone H3-K36 methylation • heart development • Метилювання • peptidyl-lysine dimethylation • histone methylation • negative regulation of cell population proliferation • histone lysine methylation • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56950	226830
Ensembl	ENSG00000143499	ENSMUSG00000026603
UniProt	Q9NRG4	Q8R5A0
RefSeq (мРНК)	NM_020197	NM_026796
RefSeq (білок)	NP_064582	NP_081072
Локус (UCSC)	Хр. 1: 214.28 – 214.34 Mb	Хр. 1: 189.61 – 189.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMYD2 (англ. SET and MYND domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 49 688.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRAEGLGGLE		RFCSPGKGRG		LRALQPFQVG		DLLFSCPAYA		YVLTVNERGN
HCEYCFTRKE		GLSKCGRCKQ		AFYCNVECQK		EDWPMHKLEC		SPMVVFGENW
NPSETVRLTA		RILAKQKIHP		ERTPSEKLLA		VKEFESHLDK		LDNEKKDLIQ
SDIAALHHFY		SKHLGFPDND		SLVVLFAQVN		CNGFTIEDEE		LSHLGSAIFP
DVALMNHSCC		PNVIVTYKGT		LAEVRAVQEI		KPGEEVFTSY		IDLLYPTEDR
NDRLRDSYFF		TCECQECTTK		DKDKAKVEIR		KLSDPPKAEA		IRDMVRYARN
VIEEFRRAKH		YKSPSELLEI		CELSQEKMSS		VFEDSNVYML		HMMYQAMGVC
LYMQDWEGAL		QYGQKIIKPY		SKHYPLYSLN		VASMWLKLGR		LYMGLEHKAA
GEKALKKAIA		IMEVAHGKDH		PYISEIKQEI		ESH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang C., Chen X., Wang Y., Gong J., Hu G. (2007). C/EBPalphap30 plays transcriptional regulatory roles distinct from C/EBPalphap42. Cell Res. 17: 374—383. PMID 17242690 DOI:10.1038/sj.cr.7310121
• Xu S., Zhong C., Zhang T., Ding J. (2011). Structure of human lysine methyltransferase Smyd2 reveals insights into the substrate divergence in Smyd proteins. J. Mol. Cell Biol. 3: 293—300. PMID 21724641 DOI:10.1093/jmcb/mjr015

Див. також

• Хромосома 1