SNPH

SNPH
Ідентифікатори
Символи	SNPH, bA314N13.5, syntaphilin
Зовнішні ІД	OMIM: 604942 MGI: 2139270 HomoloGene: 8817 GeneCards: SNPH
Онтологія гена Молекулярна функція • syntaxin-1 binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • neuron projection • cytoplasmic microtubule • міжклітинні контакти • soma • клітинна мембрана • синапс • presynaptic membrane • мітохондріальна мембрана • мембрана Біологічний процес • brain development • synaptic vesicle docking • GO:0010554 neurotransmitter secretion • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9751	241727
Ensembl	ENSG00000101298	ENSMUSG00000027457
UniProt	O15079	Q80U23
RefSeq (мРНК)	NM_014723 NM_001318234	NM_001291076 NM_001291077 NM_198214
RefSeq (білок)	NP_001305163 NP_055538	NP_001278005 NP_001278006 NP_937857
Локус (UCSC)	Хр. 20: 1.27 – 1.31 Mb	Хр. 2: 151.59 – 151.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNPH (англ. Syntaphilin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 53 537.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMSLPGSRR		TSAGSRRRTS		PPVSVRDAYG		TSSLSSSSNS		GSYKGSDSSP
TPRRSMKYTL		CSDNHGIKPP		TPEQYLTPLQ		QKEVCIRHLK		ARLKDTQDRL
QDRDTEIDDL		KTQLSRMQED		WIEEECHRVE		AQLALKEARK		EIKQLKQVID
TVKNNLIDKD		KGLQKYFVDI		NIQNKKLETL		LHSMEVAQNG		MAKEDGTGES
AGGSPARSLT		RSSTYTKLSD		PAVCGDRQPG		DPSSGSAEDG		ADSGFAAADD
TLSRTDALEA		SSLLSSGVDC		GTEETSLHSS		FGLGPRFPAS		NTYEKLLCGM
EAGVQASCMQ		ERAIQTDFVQ		YQPDLDTILE		KVTQAQVCGT		DPESGDRCPE
LDAHPSGPRD		PNSAVVVTVG		DELEAPEPIT		RGPTPQRPGA		NPNPGQSVSV
VCPMEEEEEA		AVAEKEPKSY		WSRHYIVDLL		AVVVPAVPTV		AWLCRSQRRQ
GQPIYNISSL		LRGCCTVALH		SIRRISCRSL		SQPSPSPAGG		GSQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20