SNX9

SNX9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2RAI, 2RAJ, 2RAK, 3DYT, 3DYU, 3LGE
Ідентифікатори
Символи	SNX9, SDP1, SH3PX1, SH3PXD3A, WISP, sorting nexin 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605952 MGI: 1913866 HomoloGene: 49454 GeneCards: SNX9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • Arp2/3 complex binding; • 1-phosphatidylinositol binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphatidylinositol binding; • ubiquitin protein ligase binding; • lipid binding; • cadherin binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • комплекс Ґольджі; • cell projection; • мембрана; • ruffle; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • trans-Golgi network; • екзосома; • cytoplasmic vesicle membrane; • clathrin-coated vesicle; • гіалоплазма; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • cuticular plate;
Біологічний процес	• ендоцитоз; • cleavage furrow formation; • mitotic cytokinesis; • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • plasma membrane tubulation; • поділ клітини; • endosomal transport; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation of protein oligomerization; • protein transport; • lipid tube assembly; • клітинний цикл; • intracellular protein transport; • positive regulation of protein kinase activity; • membrane organization; • GO:0007067 мітоз; • GO:0015915 транспорт; • positive regulation of actin filament polymerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51429
	66616
	ENSG00000130340
	ENSMUSG00000002365
	Q9Y5X1
	Q91VH2
	NM_016224
	NM_025664
	NP_057308
	NP_079940
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNX9 (англ. Sorting nexin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 66 592^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATKARVMYD	FAAEPGNNEL	TVNEGEIITI	TNPDVGGGWL	EGRNIKGERG
LVPTDYVEIL	PSDGKDQFSC	GNSVADQAFL	DSLSASTAQA	SSSAASNNHQ
VGSGNDPWSA	WSASKSGNWE	SSEGWGAQPE	GAGAQRNTNT	PNNWDTAFGH
PQAYQGPATG	DDDDWDEDWD	GPKSSSYFKD	SESADAGGAQ	RGNSRASSSS
MKIPLNKFPG	FAKPGTEQYL	LAKQLAKPKE	KIPIIVGDYG	PMWVYPTSTF
DCVVADPRKG	SKMYGLKSYI	EYQLTPTNTN	RSVNHRYKHF	DWLYERLLVK
FGSAIPIPSL	PDKQVTGRFE	EEFIKMRMER	LQAWMTRMCR	HPVISESEVF
QQFLNFRDEK	EWKTGKRKAE	RDELAGVMIF	STMEPEAPDL	DLVEIEQKCE
AVGKFTKAMD	DGVKELLTVG	QEHWKRCTGP	LPKEYQKIGK	ALQSLATVFS
SSGYQGETDL	NDAITEAGKT	YEEIASLVAE	QPKKDLHFLM	ECNHEYKGFL
GCFPDIIGTH	KGAIEKVKES	DKLVATSKIT	LQDKQNMVKR	VSIMSYALQA
EMNHFHSNRI	YDYNSVIRLY	LEQQVQFYET	IAEKLRQALS	RFPVM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ендоцитоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 doi:10.1042/0264-6021:3580007
Howard L., Nelson K.K., Maciewicz R.A., Blobel C.P. (1999). Interaction of the metalloprotease disintegrins MDC9 and MDC15 with two SH3 domain-containing proteins, endophilin I and SH3PX1. J. Biol. Chem. 274: 31693—31699. PMID 10531379 doi:10.1074/jbc.274.44.31693
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lin Q., Lo C.G., Cerione R.A., Yang W. (2002). The Cdc42 target ACK2 interacts with sorting nexin 9 (SH3PX1) to regulate epidermal growth factor receptor degradation. J. Biol. Chem. 277: 10134—10138. PMID 11799118 doi:10.1074/jbc.M110329200
Lundmark R., Carlsson S.R. (2003). Sorting nexin 9 participates in clathrin-mediated endocytosis through interactions with the core components. J. Biol. Chem. 278: 46772—46781. PMID 12952949 doi:10.1074/jbc.M307334200
Yeow-Fong L., Lim L., Manser E. (2005). SNX9 as an adaptor for linking synaptojanin-1 to the Cdc42 effector ACK1. FEBS Lett. 579: 5040—5048. PMID 16137687 doi:10.1016/j.febslet.2005.07.093

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14973 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9Y5X1 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14973 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9Y5X1 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]