SPEG

SPEG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1U2H
Ідентифікатори
Символи	SPEG, APEG-1, APEG1, BPEG, SPEGalpha, SPEGbeta, CNM5, SPEG complex locus, MYLK6, striated muscle enriched protein kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 615950 MGI: 109282 HomoloGene: 55619 GeneCards: SPEG
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • kinase activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • protein phosphorylation • muscle cell differentiation • muscle organ development • диференціація клітин • фосфорилювання • negative regulation of cell population proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10290	11790
Ensembl	ENSG00000072195	ENSMUSG00000026207
UniProt	Q15772	Q62407
RefSeq (мРНК)	NM_001173476 NM_005876	NM_001085370 NM_001085371 NM_001173477 NM_007463
RefSeq (білок)	NP_001166947 NP_005867	NP_001078839 NP_001078840 NP_001166948 NP_031489
Локус (UCSC)	Хр. 2: 219.43 – 219.49 Mb	Хр. 1: 75.38 – 75.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPEG (англ. SPEG complex locus) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 267 амінокислот, а молекулярна маса — 354 289.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQKARGTRGE		DAGTRAPPSP		GVPPKRAKVG		AGGGAPVAVA		GAPVFLRPLK
NAAVCAGSDV		RLRVVVSGTP		QPSLRWFRDG		QLLPAPAPEP		SCLWLRRCGA
QDAGVYSCMA		QNERGRASCE		AVLTVLEVGD		SETAEDDISD		VQGTQRLELR
DDGAFSTPTG		GSDTLVGTSL		DTPPTSVTGT		SEEQVSWWGS		GQTVLEQEAG
SGGGTRRLPG		SPRQAQATGA		GPRHLGVEPL		VRASRANLVG		ASWGSEDSLS
VASDLYGSAF		SLYRGRALSI		HVSVPQSGLR		REEPDLQPQL		ASEAPRRPAQ
PPPSKSALLP		PPSPRVGKRS		PPGPPAQPAA		TPTSPHRRTQ		EPVLPEDTTT
EEKRGKKSKS		SGPSLAGTAE		SRPQTPLSEA		SGRLSALGRS		PRLVRAGSRI
LDKLQFFEER		RRSLERSDSP		PAPLRPWVPL		RKARSLEQPK		SERGAPWGTP
GASQEELRAP		GSVAERRRLF		QQKAASLDER		TRQRSPASDL		ELRFAQELGR
IRRSTSREEL		VRSHESLRAT		LQRAPSPREP		GEPPLFSRPS		TPKTSRAVSP
AAAQPPSPSS		AEKPGDEPGR		PRSRGPAGRT		EPGEGPQQEV		RRRDQFPLTR
SRAIQECRSP		VPPPAADPPE		ARTKAPPGRK		REPPAQAVRF		LPWATPGLEG
AAVPQTLEKN		RAGPEAEKRL		RRGPEEDGPW		GPWDRRGARS		QGKGRRARPT
SPELESSDDS		YVSAGEEPLE		APVFEIPLQN		VVVAPGADVL		LKCIITANPP
PQVSWHKDGS		ALRSEGRLLL		RAEGERHTLL		LREARAADAG		SYMATATNEL
GQATCAASLT		VRPGGSTSPF		SSPITSDEEY		LSPPEEFPEP		GETWPRTPTM
KPSPSQNRRS		SDTGSKAPPT		FKVSLMDQSV		REGQDVIMSI		RVQGEPKPVV
SWLRNRQPVR		PDQRRFAEEA		EGGLCRLRIL		AAERGDAGFY		TCKAVNEYGA
RQCEARLEVR		AHPESRSLAV		LAPLQDVDVG		AGEMALFECL		VAGPTDVEVD
WLCRGRLLQP		ALLKCKMHFD		GRKCKLLLTS		VHEDDSGVYT		CKLSTAKDEL
TCSARLTVRP		SLAPLFTRLL		EDVEVLEGRA		ARFDCKISGT		PPPVVTWTHF
GCPMEESENL		RLRQDGGLHS		LHIAHVGSED		EGLYAVSAVN		THGQAHCSAQ
LYVEEPRTAA		SGPSSKLEKM		PSIPEEPEQG		ELERLSIPDF		LRPLQDLEVG
LAKEAMLECQ		VTGLPYPTIS		WFHNGHRIQS		SDDRRMTQYR		DVHRLVFPAV
GPQHAGVYKS		VIANKLGKAA		CYAHLYVTDV		VPGPPDGAPQ		VVAVTGRMVT
LTWNPPRSLD		MAIDPDSLTY		TVQHQVLGSD		QWTALVTGLR		EPGWAATGLR
KGVQHIFRVL		STTVKSSSKP		SPPSEPVQLL		EHGPTLEEAP		AMLDKPDIVY
VVEGQPASVT		VTFNHVEAQV		VWRSCRGALL		EARAGVYELS		QPDDDQYCLR
ICRVSRRDMG		ALTCTARNRH		GTQTCSVTLE		LAEAPRFESI		MEDVEVGAGE
TARFAVVVEG		KPLPDIMWYK		DEVLLTESSH		VSFVYEENEC		SLVVLSTGAQ
DGGVYTCTAQ		NLAGEVSCKA		ELAVHSAQTA		MEVEGVGEDE		DHRGRRLSDF
YDIHQEIGRG		AFSYLRRIVE		RSSGLEFAAK		FIPSQAKPKA		SARREARLLA
RLQHDCVLYF		HEAFERRRGL		VIVTELCTEE		LLERIARKPT		VCESEIRAYM
RQVLEGIHYL		HQSHVLHLDV		KPENLLVWDG		AAGEQQVRIC		DFGNAQELTP
GEPQYCQYGT		PEFVAPEIVN		QSPVSGVTDI		WPVGVVAFLC		LTGISPFVGE
NDRTTLMNIR		NYNVAFEETT		FLSLSREARG		FLIKVLVQDR		LRPTAEETLE
HPWFKTQAKG		AEVSTDHLKL		FLSRRRWQRS		QISYKCHLVL		RPIPELLRAP
PERVWVTMPR		RPPPSGGLSS		SSDSEEEELE		ELPSVPRPLQ		PEFSGSRVSL
TDIPTEDEAL		GTPETGAATP		MDWQEQGRAP		SQDQEAPSPE		ALPSPGQEPA
AGASPRRGEL		RRGSSAESAL		PRAGPRELGR		GLHKAASVEL		PQRRSPSPGA
TRLARGGLGE		GEYAQRLQAL		RQRLLRGGPE		DGKVSGLRGP		LLESLGGRAR
DPRMARAASS		EAAPHHQPPL		ENRGLQKSSS		FSQGEAEPRG		RHRRAGAPLE
IPVARLGARR		LQESPSLSAL		SEAQPSSPAR		PSAPKPSTPK		SAEPSATTPS
DAPQPPAPQP		AQDKAPEPRP		EPVRASKPAP		PPQALQTLAL		PLTPYAQIIQ
SLQLSGHAQG		PSQGPAAPPS		EPKPHAAVFA		RVASPPPGAP		EKRVPSAGGP
PVLAEKARVP		TVPPRPGSSL		SSSIENLESE		AVFEAKFKRS		RESPLSLGLR
LLSRSRSEER		GPFRGAEEED		GIYRPSPAGT		PLELVRRPER		SRSVQDLRAV
GEPGLVRRLS		LSLSQRLRRT		PPAQRHPAWE		ARGGDGESSE		GGSSARGSPV
LAMRRRLSFT		LERLSSRLQR		SGSSEDSGGA		SGRSTPLFGR		LRRATSEGES
LRRLGLPHNQ		LAAQAGATTP		SAESLGSEAS		ATSGSSAPGE		SRSRLRWGFS
RPRKDKGLSP		PNLSASVQEE		LGHQYVRSES		DFPPVFHIKL		KDQVLLEGEA
ATLLCLPAAC		PAPHISWMKD		KKSLRSEPSV		IIVSCKDGRQ		LLSIPRAGKR
HAGLYECSAT		NVLGSITSSC		TVAVARVPGK		LAPPEVPQTY		QDTALVLWKP
GDSRAPCTYT		LERRVDGESV		WHPVSSGIPD		CYYNVTHLPV		GVTVRFRVAC
ANRAGQGPFS		NSSEKVFVRG		TQDSSAVPSA		AHQEAPVTSR		PARARPPDSP
TSLAPPLAPA		APTPPSVTVS		PSSPPTPPSQ		ALSSLKAVGP		PPQTPPRRHR
GLQAARPAEP		TLPSTHVTPS		EPKPFVLDTG		TPIPASTPQG		VKPVSSSTPV
YVVTSFVSAP		PAPEPPAPEP		PPEPTKVTVQ		SLSPAKEVVS		SPGSSPRSSP
RPEGTTLRQG		PPQKPYTFLE		EKARGRFGVV		RACRENATGR		TFVAKIVPYA
AEGKRRVLQE		YEVLRTLHHE		RIMSLHEAYI		TPRYLVLIAE		SCGNRELLCG
LSDRFRYSED		DVATYMVQLL		QGLDYLHGHH		VLHLDIKPDN		LLLAPDNALK
IVDFGSAQPY		NPQALRPLGH		RTGTLEFMAP		EMVKGEPIGS		ATDIWGAGVL
TYIMLSGRSP		FYEPDPQETE		ARIVGGRFDA		FQLYPNTSQS		ATLFLRKVLS
VHPWSRPSLQ		DCLAHPWLQD		AYLMKLRRQT		LTFTTNRLKE		FLGEQRRRRA
EAATRHKVLL		RSYPGGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sutter S.B., Raeker M.O., Borisov A.B., Russell M.W. (2004). Orthologous relationship of obscurin and Unc-89: phylogeny of a novel family of tandem myosin light chain kinases. Dev. Genes Evol. 214: 352—359. PMID 15185077 DOI:10.1007/s00427-004-0413-5
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 2