SPINK5

SPINK5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H0Z, 1HDL, 1UUC, 1UVF, 1UVG
Ідентифікатори
Символи	SPINK5, LEKTI, LETKI, NETS, NS, VAKTI, serine peptidase inhibitor, Kazal type 5, serine peptidase inhibitor Kazal type 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605010 MGI: 1919682 HomoloGene: 4987 GeneCards: SPINK5
Пов'язані генетичні захворювання
Netherton syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • cell cortex • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • epidermal lamellar body • extracellular region • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • epidermal cell differentiation • negative regulation of proteolysis • negative regulation of serine-type peptidase activity • negative regulation of peptidase activity • epithelial cell differentiation • hair cell differentiation • extracellular matrix organization • negative regulation of antibacterial peptide production • negative regulation of immune response • regulation of cell adhesion • negative regulation of angiogenesis • negative regulation of serine-type endopeptidase activity • regulation of T cell differentiation • cornification • regulation of timing of anagen Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11005	72432
Ensembl	ENSG00000133710	ENSMUSG00000055561
UniProt	Q9NQ38	Q148R4
RefSeq (мРНК)	NM_001127698 NM_001127699 NM_006846	NM_001081180
RefSeq (білок)	NP_001121170 NP_001121171 NP_006837	NP_001074649
Локус (UCSC)	Хр. 5: 148.03 – 148.14 Mb	Хр. 18: 44.1 – 44.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPINK5 (англ. Serine peptidase inhibitor, Kazal type 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 064 амінокислот, а молекулярна маса — 120 714.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKIATVSVLL		PLALCLIQDA		ASKNEDQEMC		HEFQAFMKNG		KLFCPQDKKF
FQSLDGIMFI		NKCATCKMIL		EKEAKSQKRA		RHLARAPKAT		APTELNCDDF
KKGERDGDFI		CPDYYEAVCG		TDGKTYDNRC		ALCAENAKTG		SQIGVKSEGE
CKSSNPEQDV		CSAFRPFVRD		GRLGCTREND		PVLGPDGKTH		GNKCAMCAEL
FLKEAENAKR		EGETRIRRNA		EKDFCKEYEK		QVRNGRLFCT		RESDPVRGPD
GRMHGNKCAL		CAEIFKQRFS		EENSKTDQNL		GKAEEKTKVK		REIVKLCSQY
QNQAKNGILF		CTRENDPIRG		PDGKMHGNLC		SMCQAYFQAE		NEEKKKAEAR
ARNKRESGKA		TSYAELCSEY		RKLVRNGKLA		CTRENDPIQG		PDGKVHGNTC
SMCEVFFQAE		EEEKKKKEGK		SRNKRQSKST		ASFEELCSEY		RKSRKNGRLF
CTRENDPIQG		PDGKMHGNTC		SMCEAFFQQE		ERARAKAKRE		AAKEICSEFR
DQVRNGTLIC		TREHNPVRGP		DGKMHGNKCA		MCASVFKLEE		EEKKNDKEEK
GKVEAEKVKR		EAVQELCSEY		RHYVRNGRLP		CTRENDPIEG		LDGKIHGNTC
SMCEAFFQQE		AKEKERAEPR		AKVKREAEKE		TCDEFRRLLQ		NGKLFCTREN
DPVRGPDGKT		HGNKCAMCKA		VFQKENEERK		RKEEEDQRNA		AGHGSSGGGG
GNTQDECAEY		REQMKNGRLS		CTRESDPVRD		ADGKSYNNQC		TMCKAKLERE
AERKNEYSRS		RSNGTGSESG		KDTCDEFRSQ		MKNGKLICTR		ESDPVRGPDG
KTHGNKCTMC		KEKLEREAAE		KKKKEDEDRS		NTGERSNTGE		RSNDKEDLCR
EFRSMQRNGK		LICTRENNPV		RGPYGKMHIN		KCAMCQSIFD		REANERKKKD
EEKSSSKPSN		NAKDECSEFR		NYIRNNELIC		PRENDPVHGA		DGKFYTNKCY
MCRAVFLTEA		LERAKLQEKP		SHVRASQEED		SPDSFSSLDS		EMCKDYRVLP
RIGYLCPKDL		KPVCGDDGQT		YNNPCMLCHE		NLIRQTNTHI		RSTGKCEESS
TPGTTAASMP		PSDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

• Ahmed A., Kandola P., Ziada G., Parenteau N. (2001). Purification and partial amino acid sequence of proteins from human epidermal keratinocyte conditioned medium. J. Protein Chem. 20: 273—278. PMID 11594460 DOI:10.1023/A:1010902815953
• Lauber T., Schulz A., Schweimer K., Adermann K., Marx U.C. (2003). Homologous proteins with different folds: the three-dimensional structures of domains 1 and 6 of the multiple Kazal-type inhibitor LEKTI. J. Mol. Biol. 328: 205—219. PMID 12684009 DOI:10.1016/S0022-2836(03)00245-6

Див. також

• Хромосома 5