SPPL2B

SPPL2B
Ідентифікатори
Символи	SPPL2B, IMP-4, IMP4, PSH4, PSL1, signal peptide peptidase like 2B
Зовнішні ІД	OMIM: 608239 MGI: 1920468 HomoloGene: 10605 GeneCards: SPPL2B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • aspartic-type endopeptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • ендосома; • центросома; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • integral component of cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane; • Golgi membrane; • нуклеоплазма; • lysosomal membrane; • actin cytoskeleton; • Golgi-associated vesicle membrane; • лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• membrane protein proteolysis; • протеоліз; • membrane protein ectodomain proteolysis; • membrane protein intracellular domain proteolysis; • regulation of immune response; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	56928
	73218
	ENSG00000005206
	ENSMUSG00000035206
	Q8TCT7
	Q3TD49
	NM_001077238; NM_152988
	NM_175195; NM_001358803; NM_001358804
	NP_001070706; NP_694533
	NP_780404; NP_001345732; NP_001345733
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPPL2B (англ. Signal peptide peptidase like 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 64 644^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAVAAALA	RLLAAFLLLA	AQVACEYGMV	HVVSQAGGPE	GKDYCILYNP
QWAHLPHDLS	KASFLQLRNW	TASLLCSAAD	LPARGFSNQI	PLVARGNCTF
YEKVRLAQGS	GARGLLIVSR	ERLVPPGGNK	TQYDEIGIPV	ALLSYKDMLD
IFTRFGRTVR	AALYAPKEPV	LDYNMVIIFI	MAVGTVAIGG	YWAGSRDVKK
RYMKHKRDDG	PEKQEDEAVD	VTPVMTCVFV	VMCCSMLVLL	YYFYDLLVYV
VIGIFCLASA	TGLYSCLAPC	VRRLPFGKCR	IPNNSLPYFH	KRPQARMLLL
ALFCVAVSVV	WGVFRNEDQW	AWVLQDALGI	AFCLYMLKTI	RLPTFKACTL
LLLVLFLYDI	FFVFITPFLT	KSGSSIMVEV	ATGPSDSATR	EKLPMVLKVP
RLNSSPLALC	DRPFSLLGFG	DILVPGLLVA	YCHRFDIQVQ	SSRVYFVACT
IAYGVGLLVT	FVALALMQRG	QPALLYLVPC	TLVTSCAVAL	WRRELGVFWT
GSGFAKVLPP	SPWAPAPADG	PQPPKDSATP	LSPQPPSEEP	ATSPWPAEQS
PKSRTSEEMG	AGAPMREPGS	PAESEGRDQA	QPSPVTQPGA	SA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Grigorenko A.P., Moliaka Y.K., Korovaitseva G.I., Rogaev E.I. (2002). Novel class of polytopic proteins with domains associated with putative protease activity. Biochemistry (Mosc.). 67: 826—834. PMID 12139484 doi:10.1023/A:1016365227942
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 doi:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Nyborg A.C., Ladd T.B., Jansen K., Kukar T., Golde T.E. (2006). Intramembrane proteolytic cleavage by human signal peptide peptidase like 3 and malaria signal peptide peptidase. FASEB J. 20: 1671—1679. PMID 16873890 doi:10.1096/fj.06-5762com
Martin L., Fluhrer R., Haass C. (2009). Substrate requirements for SPPL2b-dependent regulated intramembrane proteolysis. J. Biol. Chem. 284: 5662—5670. PMID 19114711 doi:10.1074/jbc.M807485200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30627 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8TCT7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30627 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8TCT7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]