SSH2

SSH2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NT2
Ідентифікатори
Символи	SSH2, SSH-2, SSH-2L, slingshot protein phosphatase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606779 MGI: 2679255 HomoloGene: 14116 GeneCards: SSH2
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • actin binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет • міжклітинний простір Біологічний процес • regulation of lamellipodium assembly • regulation of axonogenesis • regulation of actin polymerization or depolymerization • GO:0016576 protein dephosphorylation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • actin cytoskeleton organization • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85464	237860
Ensembl	ENSG00000141298	ENSMUSG00000037926
UniProt	Q76I76	Q5SW75
RefSeq (мРНК)	NM_001282129 NM_001282130 NM_001282131 NM_033389	NM_001291190 NM_177710
RefSeq (білок)	NP_001269058 NP_001269059 NP_001269060 NP_203747	NP_001278119 NP_808378
Локус (UCSC)	Хр. 17: 29.63 – 29.93 Mb	Хр. 11: 77.11 – 77.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSH2 (англ. Slingshot protein phosphatase 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 423 амінокислот, а молекулярна маса — 158 216.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALVTVQRSP		TPSTTSSPCA		SEADSGEEEC		RSQPRSISES		FLTVKGAALF
LPRGNGSSTP		RISHRRNKHA		GDLQQHLQAM		FILLRPEDNI		RLAVRLESTY
QNRTRYMVVV		STNGRQDTEE		SIVLGMDFSS		NDSSTCTMGL		VLPLWSDTLI
HLDGDGGFSV		STDNRVHIFK		PVSVQAMWSA		LQSLHKACEV		ARAHNYYPGS
LFLTWVSYYE		SHINSDQSSV		NEWNAMQDVQ		SHRPDSPALF		TDIPTERERT
ERLIKTKLRE		IMMQKDLENI		TSKEIRTELE		MQMVCNLREF		KEFIDNEMIV
ILGQMDSPTQ		IFEHVFLGSE		WNASNLEDLQ		NRGVRYILNV		TREIDNFFPG
VFEYHNIRVY		DEEATDLLAY		WNDTYKFISK		AKKHGSKCLV		HCKMGVSRSA
STVIAYAMKE		YGWNLDRAYD		YVKERRTVTK		PNPSFMRQLE		EYQGILLASK
QRHNKLWRSH		SDSDLSDHHE		PICKPGLELN		KKDITTSADQ		IAEVKTMESH
PPIPPVFVEH		MVPQDANQKG		LCTKERMICL		EFTSREFHAG		QIEDELNLND
INGCSSGCCL		NESKFPLDNC		HASKALIQPG		HVPEMANKFP		DLTVEDLETD
ALKADMNVHL		LPMEELTSPL		KDPPMSPDPE		SPSPQPSCQT		EISDFSTDRI
DFFSALEKFV		ELSQETRSRS		FSHSRMEELG		GGRNESCRLS		VVEVAPSKVT
ADDQRSSSLS		NTPHASEESS		MDEEQSKAIS		ELVSPDIFMQ		SHSENAISVK
EIVTEIESIS		QGVGQIQLKG		DILPNPCHTP		KKNSIHELLL		ERAQTPENKP
GHMEQDEDSC		TAQPELAKDS		GMCNPEGCLT		THSSIADLEE		GEPAEGEQEL
QGSGMHPGAK		WYPGSVRRAT		LEFEERLRQE		QEHHGAAPTC		TSLSTRKNSK
NDSSVADLAP		KGKSDEAPPE		HSFVLKEPEM		SKGKGKYSGS		EAGSLSHSEQ
NATVPAPRVL		EFDHLPDPQE		GPGSDTGTQQ		EGVLKDLRTV		IPYQESETQA
VPLPLPKRVE		IIEYTHIVTS		PNHTGPGSEI		ATSEKSGEQG		LRKVNMEKSV
TVLCTLDENL		NRTLDPNQVS		LHPQVLPLPH		SSSPEHNRPT		DHPTSILSSP
EDRGSSLSTA		LETAAPFVSH		TTHLLSASLD		YLHPQTMVHL		EGFTEQSSTT
DEPSAEQVSW		EESQESPLSS		GSEVPYKDSQ		LSSADLSLIS		KLGDNTGELQ
EKMDPLPVAC		RLPHSSSSEN		IKSLSHSPGV		VKERAKEIES		RVVFQAGLTK
PSQMRRSASL		AKLGYLDLCK		DCLPEREPAS		CESPHLKLLQ		PFLRTDSGMH
AMEDQESLEN		PGAPHNPEPT		KSFVEQLTTT		ECIVQSKPVE		RPLVQYAKEF
GSSQQYLLPR		AGLELTSSEG		GLPVLQTQGL		QCACPAPGLA		VAPRQQHGRT
HPLRRLKKAN		DKKRTTNPFY		NTM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Niwa R., Nagata-Ohashi K., Takeichi M., Mizuno K., Uemura T. (2002). Control of actin reorganization by Slingshot, a family of phosphatases that dephosphorylate ADF/cofilin. Cell. 108: 233—246. PMID 11832213 doi:10.1016/S0092-8674(01)00638-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Chan S.Y., Chan A.K.W., Cheung B.P.K., Liang Y., Leung M.P. (2003). Identification of genes expressed during myocardial development. Chin. Med. J. 116: 1329—1332. PMID 14527359

Див. також

• Хромосома 17