STIM2

STIM2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L5Y
Ідентифікатори
Символи	STIM2, stromal interaction molecule 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610841 MGI: 2151156 HomoloGene: 32490 GeneCards: STIM2
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • store-operated calcium channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • calcium channel regulator activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • мембрана;
Біологічний процес	• ion transport; • activation of store-operated calcium channel activity; • calcium ion transport; • positive regulation of calcium ion transport; • store-operated calcium entry; • calcium ion transmembrane transport; • cellular calcium ion homeostasis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57620
	116873
	ENSG00000109689
	ENSMUSG00000039156
	Q9P246
	P83093
	NM_020860; NM_001169117; NM_001169118
	NM_001081103; NM_054083; NM_001363348
	NP_001162588; NP_001162589; NP_065911
	NP_001074572; NP_001350277; NP_473424
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STIM2 (англ. Stromal interaction molecule 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 746 амінокислот, а молекулярна маса — 83 971^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVLGLLVAG	AADGCELVPR	HLRGRRATGS	AATAASSPAA	AAGDSPALMT
DPCMSLSPPC	FTEEDRFSLE	ALQTIHKQMD	DDKDGGIEVE	ESDEFIREDM
KYKDATNKHS	HLHREDKHIT	IEDLWKRWKT	SEVHNWTLED	TLQWLIEFVE
LPQYEKNFRD	NNVKGTTLPR	IAVHEPSFMI	SQLKISDRSH	RQKLQLKALD
VVLFGPLTRP	PHNWMKDFIL	TVSIVIGVGG	CWFAYTQNKT	SKEHVAKMMK
DLESLQTAEQ	SLMDLQERLE	KAQEENRNVA	VEKQNLERKM	MDEINYAKEE
ACRLRELREG	AECELSRRQY	AEQELEQVRM	ALKKAEKEFE	LRSSWSVPDA
LQKWLQLTHE	VEVQYYNIKR	QNAEMQLAIA	KDEAEKIKKK	RSTVFGTLHV
AHSSSLDEVD	HKILEAKKAL	SELTTCLRER	LFRWQQIEKI	CGFQIAHNSG
LPSLTSSLYS	DHSWVVMPRV	SIPPYPIAGG	VDDLDEDTPP	IVSQFPGTMA
KPPGSLARSS	SLCRSRRSIV	PSSPQPQRAQ	LAPHAPHPSH	PRHPHHPQHT
PHSLPSPDPD	ILSVSSCPAL	YRNEEEEEAI	YFSAEKQWEV	PDTASECDSL
NSSIGRKQSP	PLSLEIYQTL	SPRKISRDEV	SLEDSSRGDS	PVTVDVSWGS
PDCVGLTETK	SMIFSPASKV	YNGILEKSCS	MNQLSSGIPV	PKPRHTSCSS
AGNDSKPVQE	APSVARISSI	PHDLCHNGEK	SKKPSKIKSL	FKKKSK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brandman O., Liou J., Park W.S., Meyer T. (2007). STIM2 is a feedback regulator that stabilizes basal cytosolic and endoplasmic reticulum Ca2+ levels. Cell. 131: 1327—1339. PMID 18160041 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.039
Zheng L., Stathopulos P.B., Li G.-Y., Ikura M. (2008). Biophysical characterization of the EF-hand and SAM domain containing Ca2+ sensory region of STIM1 and STIM2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 369: 240—246. PMID 18166150 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.12.129
Stathopulos P.B., Zheng L., Ikura M. (2009). Stromal interaction molecule (STIM) 1 and STIM2 calcium sensing regions exhibit distinct unfolding and oligomerization kinetics. J. Biol. Chem. 284: 728—732. PMID 19019825 DOI:10.1074/jbc.C800178200
Palty R., Raveh A., Kaminsky I., Meller R., Reuveny E. (2012). SARAF inactivates the store operated calcium entry machinery to prevent excess calcium refilling. Cell. 149: 425—438. PMID 22464749 DOI:10.1016/j.cell.2012.01.055

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з STIM2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19205 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9P246 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з STIM2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19205 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q9P246 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]