STUB1

STUB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4KBQ
Ідентифікатори
Символи	STUB1, CHIP, HSPABP2, NY-CO-7, SCAR16, SDCCAG7, UBOX1, STIP1 homology and U-box containing protein 1, SCA48
Зовнішні ІД	OMIM: 607207 MGI: 1891731 HomoloGene: 4281 GeneCards: STUB1
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive spinocerebellar ataxia 16
Онтологія гена Молекулярна функція • Hsp90 protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • protein homodimerization activity • misfolded protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin-ubiquitin ligase activity • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • TPR domain binding • G protein-coupled receptor binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • Hsp70 protein binding • SMAD binding • heat shock protein binding • tau protein binding • chaperone binding Клітинна компонента • цитоплазма • ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • Z disc • ендоплазматичний ретикулум • nuclear inclusion body • екзосома • ubiquitin conjugating enzyme complex • клітинне ядро • гіалоплазма • chaperone complex Біологічний процес • positive regulation of chaperone-mediated protein complex assembly • regulation of protein stability • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of glucocorticoid metabolic process • protein K63-linked ubiquitination • protein maturation • protein polyubiquitination • protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins • negative regulation of protein binding • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process • cellular response to DNA damage stimulus • Відповідь на незгорнуті білки • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0100026 Репарація ДНК • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • cellular response to misfolded protein • ERBB2 signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • ubiquitin-dependent ERAD pathway • response to ischemia • cellular response to heat • chaperone-mediated autophagy • cellular response to hypoxia Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10273	56424
Ensembl	ENSG00000103266	ENSMUSG00000039615
UniProt	Q9UNE7	Q9WUD1
RefSeq (мРНК)	NM_005861 NM_001293197	NM_019719
RefSeq (білок)	NP_001280126 NP_005852	NP_062693
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.68 – 0.68 Mb	Хр. 17: 26.05 – 26.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STUB1 (англ. STIP1 homology and U-box containing protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 303 амінокислот, а молекулярна маса — 34 856.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKGKEEKEGG		ARLGAGGGSP		EKSPSAQELK		EQGNRLFVGR		KYPEAAACYG
RAITRNPLVA		VYYTNRALCY		LKMQQHEQAL		ADCRRALELD		GQSVKAHFFL
GQCQLEMESY		DEAIANLQRA		YSLAKEQRLN		FGDDIPSALR		IAKKKRWNSI
EERRIHQESE		LHSYLSRLIA		AERERELEEC		QRNHEGDEDD		SHVRAQQACI
EAKHDKYMAD		MDELFSQVDE		KRKKRDIPDY		LCGKISFELM		REPCITPSGI
TYDRKDIEEH		LQRVGHFDPV		TRSPLTQEQL		IPNLAMKEVI		DAFISENGWV
EDY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hatakeyama S., Yada M., Matsumoto M., Ishida N., Nakayama K.I. (2001). U box proteins as a new family of ubiquitin-protein ligases. J. Biol. Chem. 276: 33111—33120. PMID 11435423 DOI:10.1074/jbc.M102755200
• Alberti S., Boehse K., Arndt V., Schmitz A., Hoehfeld J. (2004). The cochaperone HspBP1 inhibits the CHIP ubiquitin ligase and stimulates the maturation of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator. Mol. Biol. Cell. 15: 4003—4010. PMID 15215316 DOI:10.1091/mbc.E04-04-0293
• Windheim M., Peggie M., Cohen P. (2008). Two different classes of E2 ubiquitin-conjugating enzymes are required for the mono-ubiquitination of proteins and elongation by polyubiquitin chains with a specific topology. Biochem. J. 409: 723—729. PMID 18042044 DOI:10.1042/BJ20071338
• Annamalai B., Liu X., Gopal U., Isaacs J.S. (2009). Hsp90 is an essential regulator of EphA2 receptor stability and signaling: implications for cancer cell migration and metastasis. Mol. Cancer Res. 7: 1021—1032. PMID 19567782 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-08-0582
• Tatham M.H., Plechanovova A., Jaffray E.G., Salmen H., Hay R.T. (2013). Ube2W conjugates ubiquitin to alpha-amino groups of protein N-termini. Biochem. J. 453: 137—145. PMID 23560854 DOI:10.1042/BJ20130244

Див. також

• Хромосома 16