TAF1A

TAF1A
Ідентифікатори
Символи	TAF1A, MGC:17061, RAFI48, SL1, TAFI48, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A
Зовнішні ІД	OMIM: 604903 MGI: 109578 HomoloGene: 4155 GeneCards: TAF1A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • microtubule cytoskeleton • RNA polymerase I transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription by RNA polymerase I • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9015	21339
Ensembl	ENSG00000143498	ENSMUSG00000072258
UniProt	Q15573 Q5JRA7	P97357
RefSeq (мРНК)	NM_001201536 NM_005681 NM_139352	NM_001277957 NM_001277958 NM_001277959 NM_021466
RefSeq (білок)	NP_001188465 NP_005672 NP_647603	NP_001264886 NP_001264887 NP_001264888 NP_067441
Локус (UCSC)	Хр. 1: 222.56 – 222.59 Mb	Хр. 1: 183.17 – 183.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF1A (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 52 676.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDFSEELKG		PVTDDEEVET		SVLSGAGMHF		PWLQTYVETV		AIGGKRRKDF
AQTTSACLSF		IQEALLKHQW		QQAAEYMYSY		FQTLEDSDSY		KRQAAPEIIW
KLGSEILFYH		PKSNMESFNT		FANRMKNIGV		MNYLKISLQH		ALYLLHHGML
KDAKRNLSEA		ETWRHGENTS		SREILINLIQ		AYKGLLQYYT		WSEKKMELSK
LDKDDYAYNA		VAQDVFNHSW		KTSANISALI		KIPGVWDPFV		KSYVEMLEFY
GDRDGAQEVL		TNYAYDEKFP		SNPNAHIYLY		NFLKRQKAPR		SKLISVLKIL
YQIVPSHKLM		LEFHTLLRKS		EKEEHRKLGL		EVLFGVLDFA		GCTKNITAWK
YLAKYLKNIL		MGNHLAWVQE		EWNSRKNWWP		GFHFSYFWAK		SDWKEDTALA
CEKAFVAGLL		LGKGCRYFRY		ILKQDHQILG		KKIKRMKRSV		KKYSIVNPRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beckmann H., Chen J.L., O'Brien T., Tjian R. (1995). Coactivator and promoter-selective properties of RNA polymerase I TAFs. Science. 270: 1506—1509. PMID 7491500 DOI:10.1126/science.270.5241.1506
• Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200
• Muller C., Bremer A., Schreiber S., Eichwald S., Calkhoven C.F. (2010). Nucleolar retention of a translational C/EBPalpha isoform stimulates rDNA transcription and cell size. EMBO J. 29: 897—909. PMID 20075868 DOI:10.1038/emboj.2009.404

Див. також

• Хромосома 1