TBC1D22A

TBC1D22A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2QFZ
Ідентифікатори
Символи	TBC1D22A, C22orf4, HSC79E021, TBC1 domain family member 22A
Зовнішні ІД	OMIM: 616879 MGI: 1289265 HomoloGene: 105406 GeneCards: TBC1D22A
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • 14-3-3 protein binding Клітинна компонента • система ендомембран • внутрішньоклітинний Біологічний процес • regulation of cilium assembly • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • intracellular protein transport • regulation of vesicle fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25771	223754
Ensembl	ENSG00000054611	ENSMUSG00000051864
UniProt	Q8WUA7	Q8R5A6
RefSeq (мРНК)	NM_001284303 NM_001284304 NM_001284305 NM_014346	NM_145476 NM_001358062
RefSeq (білок)	NP_001271232 NP_001271233 NP_001271234 NP_055161	NP_663451 NP_001344991
Локус (UCSC)	Хр. 22: 46.76 – 47.18 Mb	Хр. 15: 86.21 – 86.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBC1D22A (англ. TBC1 domain family member 22A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 59 121.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASDGARKQF		WKRSNSKLPG		SIQHVYGAQH		PPFDPLLHGT		LLRSTAKMPT
TPVKAKRVST		FQEFESNTSD		AWDAGEDDDE		LLAMAAESLN		SEVVMETANR
VLRNHSQRQG		RPTLQEGPGL		QQKPRPEAEP		PSPPSGDLRL		VKSVSESHTS
CPAESASDAA		PLQRSQSLPH		SATVTLGGTS		DPSTLSSSAL		SEREASRLDK
FKQLLAGPNT		DLEELRRLSW		SGIPKPVRPM		TWKLLSGYLP		ANVDRRPATL
QRKQKEYFAF		IEHYYDSRND		EVHQDTYRQI		HIDIPRMSPE		ALILQPKVTE
IFERILFIWA		IRHPASGYVQ		GINDLVTPFF		VVFICEYIEA		EEVDTVDVSG
VPAEVLCNIE		ADTYWCMSKL		LDGIQDNYTF		AQPGIQMKVK		MLEELVSRID
EQVHRHLDQH		EVRYLQFAFR		WMNNLLMREV		PLRCTIRLWD		TYQSEPDGFS
HFHLYVCAAF		LVRWRKEILE		EKDFQELLLF		LQNLPTAHWD		DEDISLLLAE
AYRLKFAFAD		APNHYKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 doi:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Greninger A.L., Knudsen G.M., Betegon M., Burlingame A.L., DeRisi J.L. (2013). ACBD3 interaction with TBC1 domain 22 protein is differentially affected by enteroviral and kobuviral 3A protein binding. MBio. 4: E00098—E00098. PMID 23572552 doi:10.1128/mBio.00098-13
• Tempel W., Tong Y., Dimov S., Bochkarev A., Park H. (2008). First crystallographic models of human TBC domains in the context of a family-wide structural analysis. Proteins. 71: 497—502. PMID 18186464 doi:10.1002/prot.21885

Див. також

• Хромосома 22