TFB1M

TFB1M
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GC5, 4GC9
Ідентифікатори
Символи	TFB1M, CGI75, mtTFB, mtTFB1, CGI-75, transcription factor B1, mitochondrial
Зовнішні ІД	OMIM: 607033 MGI: 2146851 HomoloGene: 9343 GeneCards: TFB1M
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • rRNA methyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity • RNA binding Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • mitochondrial nucleoid • мітохондрія Біологічний процес • rRNA processing • Метилювання • mitochondrion organization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • rRNA methylation • transcription, DNA-templated • rRNA modification Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51106	224481
Ensembl	ENSG00000029639	ENSMUSG00000036983
UniProt	Q8WVM0	Q8JZM0
RefSeq (мРНК)	NM_016020 NM_001350501 NM_001350502	NM_146074
RefSeq (білок)	NP_057104 NP_001337430 NP_001337431	NP_666186
Локус (UCSC)	Хр. 6: 155.26 – 155.31 Mb	Хр. 17: 3.57 – 3.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TFB1M (англ. Transcription factor B1, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 543.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASGKLSTC		RLPPLPTIRE		IIKLLRLQAA		KQLSQNFLLD		LRLTDKIVRK
AGNLTNAYVY		EVGPGPGGIT		RSILNADVAE		LLVVEKDTRF		IPGLQMLSDA
APGKLRIVHG		DVLTFKVEKA		FSESLKRPWE		DDPPNVHIIG		NLPFSVSTPL
IIKWLENISC		RDGPFVYGRT		QMTLTFQKEV		AERLAANTGS		KQRSRLSVMA
QYLCNVRHIF		TIPGQAFVPK		PEVDVGVVHF		TPLIQPKIEQ		PFKLVEKVVQ
NVFQFRRKYC		HRGLRMLFPE		AQRLESTGRL		LELADIDPTL		RPRQLSISHF
KSLCDVYRKM		CDEDPQLFAY		NFREELKRRK		SKNEEKEEDD		AENYRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесінг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McCulloch V., Seidel-Rogol B.L., Shadel G.S. (2002). A human mitochondrial transcription factor is related to RNA adenine methyltransferases and binds S-adenosylmethionine. Mol. Cell. Biol. 22: 1116—1125. PMID 11809803 DOI:10.1128/MCB.22.4.1116-1125.2002
• McCulloch V., Shadel G.S. (2003). Human mitochondrial transcription factor B1 interacts with the C-terminal activation region of h-mtTFA and stimulates transcription independently of its RNA methyltransferase activity. Mol. Cell. Biol. 23: 5816—5824. PMID 12897151 DOI:10.1128/MCB.23.16.5816-5824.2003
• Seidel-Rogol B.L., McCulloch V., Shadel G.S. (2003). Human mitochondrial transcription factor B1 methylates ribosomal RNA at a conserved stem-loop. Nat. Genet. 33: 23—24. PMID 12496758 DOI:10.1038/ng1064
• Gleyzer N., Vercauteren K., Scarpulla R.C. (2005). Control of mitochondrial transcription specificity factors (TFB1M and TFB2M) by nuclear respiratory factors (NRF-1 and NRF-2) and PGC-1 family coactivators. Mol. Cell. Biol. 25: 1354—1366. PMID 15684387 DOI:10.1128/MCB.25.4.1354-1366.2005

Див. також

• Хромосома 6