TGS1

TGS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EGI, 3GDH
Ідентифікатори
Символи	TGS1, NCOA6IP, PIMT, PIPMT, trimethylguanosine synthase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606461 MGI: 2151797 HomoloGene: 32608 GeneCards: TGS1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • RNA trimethylguanosine synthase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA methyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • Тільце Кахаля • нуклеоплазма • ядерце • small nuclear ribonucleoprotein complex • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • spliceosomal snRNP assembly • Метилювання • 7-methylguanosine RNA capping • 7-methylguanosine cap hypermethylation • ribonucleoprotein complex biogenesis • RNA methylation • regulation of lipid metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	96764	116940
Ensembl	ENSG00000137574	ENSMUSG00000028233
UniProt	Q96RS0	Q923W1
RefSeq (мРНК)	NM_024831 NM_001317902 NM_001363184	NM_054089
RefSeq (білок)	NP_001304831 NP_079107 NP_001350113	NP_473430
Локус (UCSC)	Хр. 8: 55.77 – 55.83 Mb	Хр. 4: 3.57 – 3.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TGS1 (англ. Trimethylguanosine synthase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 96 620.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCCEKWSRVA		EMFLFIEERE		DCKILCLCSR		AFVEDRKLYN		LGLKGYYIRD
SGNNSGDQAT		EEEEGGYSCG		TAESHDSKGI		GLDESELDSE		AELMRSMGLP
LQFGRITAHK		DFEVSMNTRN		KVKIKKKKHQ		KKYLDEIVQE		SWRKEYEEDD
ILASDDPSSI		EQYENTRTYE		LQSKKDTETE		NPPVENTLSP		KLEITEKWEK
YWNEYGGGLL		WQSWQEKHPG		QALSSEPWNF		PDTKEEWEQH		YSQLYWYYLE
QFQYWEAQGW		TFDASQSCDT		DTYTSKTEAD		DKNDEKCMKV		DLVSFPSSPI
MVDNDSSGTS		DKDHSEILDG		ISNIKLNSEE		VTQSQLDSCT		SHDGHQQLSE
VSSKRECPAS		GQSEPRNGGT		NEESNSSGNT		NTDPPAEDSQ		KSSGANTSKD
RPHASGTDGD		ESEEDPPEHK		PSKLKRSHEL		DIDENPASDF		DDSGSLLGFK
YGSGQKYGGI		PNFSHRQVRY		LEKNVKLKSK		YLDMRRQIKM		KNKHIFFTKE
SEKPFFKKSK		ILSKVEKFLT		WVNKPMDEEA		SQESSSHDNV		HDASTSSDSE
EQDMSVKKGD		DLLETNNPEP		EKCQSVSSAG		ELETENYERD		SLLATVPDEQ
DCVTQEVPDS		RQAETEAEVK		KKKNKKKNKK		VNGLPPEIAA		VPELAKYWAQ
RYRLFSRFDD		GIKLDREGWF		SVTPEKIAEH		IAGRVSQSFK		CDVVVDAFCG
VGGNTIQFAL		TGMRVIAIDI		DPVKIALARN		NAEVYGIADK		IEFICGDFLL
LASFLKADVV		FLSPPWGGPD		YATAETFDIR		TMMSPDGFEI		FRLSKKITNN
IVYFLPRNAD		IDQVASLAGP		GGQVEIEQNF		LNNKLKTITA		YFGDLIRRPA
SET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Monecke T., Dickmanns A., Strasser A., Ficner R. (2009). Structure analysis of the conserved methyltransferase domain of human trimethylguanosine synthase TGS1. Acta Crystallogr. D. 65: 332—338. PMID 19307714 DOI:10.1107/S0907444909003102
• Monecke T., Dickmanns A., Ficner R. (2009). Structural basis for m7G-cap hypermethylation of small nuclear, small nucleolar and telomerase RNA by the dimethyltransferase TGS1. Nucleic Acids Res. 37: 3865—3877. PMID 19386620 DOI:10.1093/nar/gkp249

Див. також

• Хромосома 8