TRIM13

TRIM13
Ідентифікатори
Символи	TRIM13, CAR, DLEU5, LEU5, RFP2, RNF77, tripartite motif containing 13
Зовнішні ІД	OMIM: 605661 MGI: 1913847 HomoloGene: 4234 GeneCards: TRIM13
Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding; • signal transducer activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • perinuclear endoplasmic reticulum; • внутрішньоклітинний; • ендоплазматичний ретикулум; • цитоплазма; • endoplasmic reticulum membrane; • endoplasmic reticulum quality control compartment;
Біологічний процес	• positive regulation of cell death; • anatomical structure morphogenesis; • positive regulation of macroautophagy; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • Убіквітин-залежний протеоліз; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • вроджений імунітет; • response to gamma radiation; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein autoubiquitination; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • endoplasmic reticulum mannose trimming;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10206
	66597
	ENSG00000204977
	ENSMUSG00000035235
	O60858
	Q9CYB0
	NM_213590; NM_001007278; NM_005798; NM_052811
	NM_001164220; NM_023233
	NP_001007279; NP_005789; NP_434698; NP_998755
	NP_001157692; NP_075722
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRIM13 (англ. Tripartite motif containing 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 46 988^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELLEEDLTC	PICCSLFDDP	RVLPCSHNFC	KKCLEGILEG	SVRNSLWRPA
PFKCPTCRKE	TSATGINSLQ	VNYSLKGIVE	KYNKIKISPK	MPVCKGHLGQ
PLNIFCLTDM	QLICGICATR	GEHTKHVFCS	IEDAYAQERD	AFESLFQSFE
TWRRGDALSR	LDTLETSKRK	SLQLLTKDSD	KVKEFFEKLQ	HTLDQKKNEI
LSDFETMKLA	VMQAYDPEIN	KLNTILQEQR	MAFNIAEAFK	DVSEPIVFLQ
QMQEFREKIK	VIKETPLPPS	NLPASPLMKN	FDTSQWEDIK	LVDVDKLSLP
QDTGTFISKI	PWSFYKLFLL	ILLLGLVIVF	GPTMFLEWSL	FDDLATWKGC
LSNFSSYLTK	TADFIEQSVF	YWEQVTDGFF	IFNERFKNFT	LVVLNNVAEF
VCKYKLL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tomar D., Singh R., Singh A.K., Pandya C.D., Singh R. (2012). TRIM13 regulates ER stress induced autophagy and clonogenic ability of the cells. Biochim. Biophys. Acta. 1823: 316—326. PMID 22178386 DOI:10.1016/j.bbamcr.2011.11.015