TRIM63

TRIM63
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3DDT, 4M3L, 2D8U
Ідентифікатори
Символи	TRIM63, IRF, MURF1, MURF2, RNF28, SMRZ, tripartite motif containing 63
Зовнішні ІД	OMIM: 606131 MGI: 2447992 HomoloGene: 41878 GeneCards: TRIM63
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • titin binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • M band • contractile fiber • Z disc • мікротрубочка • клітинне ядро • внутрішньоклітинний Біологічний процес • skeletal muscle atrophy • м'язове скорочення • response to glucocorticoid • response to interleukin-1 • Убіквітин-залежний протеоліз • response to electrical stimulus involved in regulation of muscle adaptation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84676	433766
Ensembl	ENSG00000158022	ENSMUSG00000028834
UniProt	Q969Q1	Q38HM4
RefSeq (мРНК)	NM_032588	NM_001039048 NM_001369245
RefSeq (білок)	NP_115977	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 26.05 – 26.07 Mb	Хр. 4: 134.04 – 134.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM63 (англ. Tripartite motif containing 63) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 353 амінокислот, а молекулярна маса — 40 248.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDYKSSLIQD		GNPMENLEKQ		LICPICLEMF		TKPVVILPCQ		HNLCRKCAND
IFQAANPYWT		SRGSSVSMSG		GRFRCPTCRH		EVIMDRHGVY		GLQRNLLVEN
IIDIYKQECS		SRPLQKGSHP		MCKEHEDEKI		NIYCLTCEVP		TCSMCKVFGI
HKACEVAPLQ		SVFQGQKTEL		NNCISMLVAG		NDRVQTIITQ		LEDSRRVTKE
NSHQVKEELS		QKFDTLYAIL		DEKKSELLQR		ITQEQEKKLS		FIEALIQQYQ
EQLDKSTKLV		ETAIQSLDEP		GGATFLLTAK		QLIKSIVEAS		KGCQLGKTEQ
GFENMDFFTL		DLEHIADALR		AIDFGTDEEE		EEFIEEEDQE		EEESTEGKEE
GHQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, м'язових білків. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Є маркером м'язової атрофії.

Література

• Dai K.-S., Liew C.-C. (2001). A novel human striated muscle RING zinc finger protein, SMRZ, interacts with SMT3b via its RING domain. J. Biol. Chem. 276: 23992—23999. PMID 11283016 DOI:10.1074/jbc.M011208200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McElhinny A.S., Kakinuma K., Sorimachi H., Labeit S., Gregorio C.C. (2002). Muscle-specific RING finger-1 interacts with titin to regulate sarcomeric M-line and thick filament structure and may have nuclear functions via its interaction with glucocorticoid modulatory element binding protein-1. J. Cell Biol. 157: 125—136. PMID 11927605 DOI:10.1083/jcb.200108089

Див. також

• Хромосома 1