TRMT5

TRMT5
Ідентифікатори
Символи	TRMT5, KIAA1393, TRM5, COXPD26, tRNA methyltransferase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 611023 MGI: 1923607 HomoloGene: 6096 GeneCards: TRMT5
Пов'язані генетичні захворювання
combined oxidative phosphorylation defect type 26
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase activity • tRNA (guanine(37)-N(1))-methyltransferase activity • tRNA methyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • клітинне ядро Біологічний процес • Метилювання • tRNA methylation • mitochondrial tRNA methylation • tRNA processing • tRNA N1-guanine methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57570	76357
Ensembl	ENSG00000126814	ENSMUSG00000034442
UniProt	Q32P41	Q9D0C4
RefSeq (мРНК)	NM_020810 NM_001350253 NM_001350254	NM_029580
RefSeq (білок)	NP_065861 NP_001337182 NP_001337183	NP_083856
Локус (UCSC)	Хр. 14: 60.97 – 60.98 Mb	Хр. 12: 73.33 – 73.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRMT5 (англ. TRNA methyltransferase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 246.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLWILWRPF		GFSGRFLKLE		SHSITESKSL		IPVAWTSLTQ		MLLEAPGIFL
LGQRKRFSTM		PETETHERET		ELFSPPSDVR		GMTKLDRTAF		KKTVNIPVLK
VRKEIVSKLM		RSLKRAALQR		PGIRRVIEDP		EDKESRLIML		DPYKIFTHDS
FEKAELSVLE		QLNVSPQISK		YNLELTYEHF		KSEEILRAVL		PEGQDVTSGF
SRIGHIAHLN		LRDHQLSFKH		LIGQVMIDKN		PGITSAVNKI		NNIDNMYRNF
QMEVLSGEQN		MMTKVRENNY		TYEFDFSKVY		WNPRLSTEHS		RITELLKPGD
VLFDVFAGVG		PFAIPVAKKN		CTVFANDLNP		ESHKWLLYNC		KLNKVDQKVK
VFNLDGKDFL		QGPVKEELMQ		LLGLSKERKP		SVHVVMNLPA		KAIEFLSAFK
WLLDGQPCSS		EFLPIVHCYS		FSKDANPAED		VRQRAGAVLG		ISLEACSSVH
LVRNVAPNKE		MLCITFQIPA		SVLYKNQTRN		PENHEDPPLK		RQRTAEAFSD
EKTQIVSNT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг тРНК. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Brule H., Elliott M., Redlak M., Zehner Z.E., Holmes W.M. (2004). Isolation and characterization of the human tRNA-(N1G37) methyltransferase (TRM5) and comparison to the Escherichia coli TrmD protein. Biochemistry. 43: 9243—9255. PMID 15248782 DOI:10.1021/bi049671q

Див. також

• Хромосома 14