TRMT61A

TRMT61A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5CCB, 5CD1, 5CCX
Ідентифікатори
Символи	TRMT61A, C14orf172, GCD14, Gcd14p, TRM61, hTRM61, tRNA methyltransferase 61A
Зовнішні ІД	MGI: 2443487 HomoloGene: 6229 GeneCards: TRMT61A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity • mRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • tRNA (m1A) methyltransferase complex Біологічний процес • Метилювання • tRNA methylation • tRNA processing • mRNA methylation • tRNA modification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	115708	328162
Ensembl	ENSG00000166166	ENSMUSG00000060950
UniProt	Q96FX7	Q80XC2
RefSeq (мРНК)	NM_152307	NM_001099792 NM_001099793 NM_177374
RefSeq (білок)	NP_689520	NP_001093262 NP_001093263 NP_796348
Локус (UCSC)	Хр. 14: 103.53 – 103.54 Mb	Хр. 12: 111.64 – 111.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRMT61A (англ. TRNA methyltransferase 61A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 289 амінокислот, а молекулярна маса — 31 382.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFVAYEELI		KEGDTAILSL		GHGAMVAVRV		QRGAQTQTRH		GVLRHSVDLI
GRPFGSKVTC		GRGGWVYVLH		PTPELWTLNL		PHRTQILYST		DIALITMMLE
LRPGSVVCES		GTGSGSVSHA		IIRTIAPTGH		LHTVEFHQQR		AEKAREEFQE
HRVGRWVTVR		TQDVCRSGFG		VSHVADAVFL		DIPSPWEAVG		HAWDALKVEG
GRFCSFSPCI		EQVQRTCQAL		AARGFSELST		LEVLPQVYNV		RTVSLPPPDL
GTGTDGPAGS		DTSPFRSGTP		MKEAVGHTGY		LTFATKTPG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ozanick S., Krecic A., Andersland J., Anderson J.T. (2005). The bipartite structure of the tRNA m1A58 methyltransferase from S. cerevisiae is conserved in humans. RNA. 11: 1281—1290. PMID 16043508 DOI:10.1261/rna.5040605
• Finer-Moore J., Czudnochowski N., O'Connell J.D. III, Wang A.L., Stroud R.M. (2015). Crystal structure of the human tRNA m(1)A58 methyltransferase-tRNA(3)(Lys) complex: refolding of substrate tRNA allows access to the methylation target. J. Mol. Biol. 427: 3862—3876. PMID 26470919 DOI:10.1016/j.jmb.2015.10.005

Див. також

• Хромосома 14