U2AF1

U2AF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JMT
Ідентифікатори
Символи	U2AF1, FP793, RN, RNU2AF35, U2AFBP, U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191317 HomoloGene: 134334 GeneCards: U2AF1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • pre-mRNA 3'-splice site binding • RNA binding • RS domain binding Клітинна компонента • Тільце Кахаля • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • U2AF complex • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро Біологічний процес • termination of RNA polymerase II transcription • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • mRNA processing • mRNA export from nucleus • regulation of autophagy of mitochondrion • Сплайсинг РНК • mRNA 3'-end processing • RNA export from nucleus • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7307	192328
Ensembl	ENSG00000160201	ENSDARG00000015325
UniProt	Q01081 P0DN76	Q8JHJ3
RefSeq (мРНК)	NM_001025203 NM_001025204 NM_006758	NM_177479
RefSeq (білок)	NP_001307575 NP_001307577 NP_001307579 NP_001307580 NP_001020374 NP_001020375 NP_006749 NP_001020374 NP_001020375 NP_006749	NP_803432
Локус (UCSC)	Хр. 21: 43.09 – 43.11 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

U2AF1 (англ. Splicing factor U2AF 35 kDa subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 27 872.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEYLASIFG		TEKDKVNCSF		YFKIGACRHG		DRCSRLHNKP		TFSQTIALLN
IYRNPQNSSQ		SADGLRCAVS		DVEMQEHYDE		FFEEVFTEME		EKYGEVEEMN
VCDNLGDHLV		GNVYVKFRRE		EDAEKAVIDL		NNRWFNGQPI		HAELSPVTDF
REACCRQYEM		GECTRGGFCN		FMHLKPISRE		LRRELYGRRR		KKHRSRSRSR
ERRSRSRDRG		RGGGGGGGGG		GGGRERDRRR		SRDRERSGRF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhang M., Zamore P.D., Carmo-Fonseca M., Lamond A.I., Green M.R. (1992). Cloning and intracellular localization of the U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor small subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 8769—8773. PMID 1388271 DOI:10.1073/pnas.89.18.8769
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zuo P., Maniatis T. (1996). The splicing factor U2AF35 mediates critical protein-protein interactions in constitutive and enhancer-dependent splicing. Genes Dev. 10: 1356—1368. PMID 8647433 DOI:10.1101/gad.10.11.1356
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Kielkopf C.L., Rodionova N.A., Green M.R., Burley S.K. (2001). A novel peptide recognition mode revealed by the X-ray structure of a core U2AF35/U2AF65 heterodimer. Cell. 106: 595—605. PMID 11551507 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00480-9

Див. також

• Хромосома 21