UBE2S

UBE2S
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZDN, 5BNB
Ідентифікатори
Символи	UBE2S, E2-EPF, E2EPF, EPF5, ubiquitin conjugating enzyme E2 S
Зовнішні ІД	OMIM: 610309 MGI: 1925141 HomoloGene: 56676 GeneCards: UBE2S
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ATP binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • anaphase-promoting complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • anaphase-promoting complex • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • protein K29-linked ubiquitination • free ubiquitin chain polymerization • protein K63-linked ubiquitination • exit from mitosis • protein K27-linked ubiquitination • protein K11-linked ubiquitination • поділ клітини • protein K6-linked ubiquitination • клітинний цикл • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • GO:0090623, GO:1903835, GO:0007092, GO:0051488, GO:0051487 positive regulation of ubiquitin protein ligase activity • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27338	77891
Ensembl	ENSG00000108106	ENSMUSG00000060860
UniProt	Q16763	Q921J4
RefSeq (мРНК)	NM_014501	NM_133777
RefSeq (білок)	NP_055316	NP_598538
Локус (UCSC)	Хр. 19: 55.4 – 55.41 Mb	Хр. 7: 4.8 – 4.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBE2S (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 S) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 222 амінокислот, а молекулярна маса — 23 845.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSNVENLPP		HIIRLVYKEV		TTLTADPPDG		IKVFPNEEDL		TDLQVTIEGP
EGTPYAGGLF		RMKLLLGKDF		PASPPKGYFL		TKIFHPNVGA		NGEICVNVLK
RDWTAELGIR		HVLLTIKCLL		IHPNPESALN		EEAGRLLLEN		YEEYAARARL
LTEIHGGAGG		PSGRAEAGRA		LASGTEASST		DPGAPGGPGG		AEGPMAKKHA
GERDKKLAAK		KKTDKKRALR		RL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003
• Bremm A., Freund S.M., Komander D. (2010). Lys11-linked ubiquitin chains adopt compact conformations and are preferentially hydrolyzed by the deubiquitinase Cezanne. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 939—947. PMID 20622874 DOI:10.1038/nsmb.1873
• Lorenz S., Bhattacharyya M., Feiler C., Rape M., Kuriyan J. (2016). Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate. PLoS ONE. 11: E0147550—E0147550. PMID 26828794 DOI:10.1371/journal.pone.0147550
• Liu Z., Diaz L.A., Haas A.L., Giudice G.J. (1992). cDNA cloning of a novel human ubiquitin carrier protein. An antigenic domain specifically recognized by endemic pemphigus foliaceus autoantibodies is encoded in a secondary reading frame of this human epidermal transcript. J. Biol. Chem. 267: 15829—15835. PMID 1379239

Див. також

• Хромосома 19