USP16

USP16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I50
Ідентифікатори
Символи	USP16, UBP-M, UBPM, ubiquitin specific peptidase 16
Зовнішні ІД	OMIM: 604735 MGI: 1921362 HomoloGene: 38183 GeneCards: USP16
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • cysteine-type endopeptidase activity • GO:0031493 histone binding • ubiquitin binding • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of translational elongation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • monoubiquitinated histone H2A deubiquitination • transcription, DNA-templated • протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • histone H2A K63-linked deubiquitination • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein homotetramerization • регуляція експресії генів • histone deubiquitination • regulation of cell cycle • GO:0007067 мітоз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • клітинний цикл • mitotic nuclear division Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10600	74112
Ensembl	ENSG00000156256	ENSMUSG00000025616
UniProt	Q9Y5T5	Q99LG0
RefSeq (мРНК)	NM_006447 NM_001001992 NM_001032410	NM_024258
RefSeq (білок)	NP_001001992 NP_001027582 NP_006438	NP_077220
Локус (UCSC)	Хр. 21: 29.02 – 29.05 Mb	Хр. 16: 87.45 – 87.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP16 (англ. Ubiquitin specific peptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 823 амінокислот, а молекулярна маса — 93 570.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKKRTKGKT		VPIDDSSETL		EPVCRHIRKG		LEQGNLKKAL		VNVEWNICQD
CKTDNKVKDK		AEEETEEKPS		VWLCLKCGHQ		GCGRNSQEQH		ALKHYLTPRS
EPHCLVLSLD		NWSVWCYVCD		NEVQYCSSNQ		LGQVVDYVRK		QASITTPKPA
EKDNGNIELE		NKKLEKESKN		EQEREKKENM		AKENPPMNSP		CQITVKGLSN
LGNTCFFNAV		MQNLSQTPVL		RELLKEVKMS		GTIVKIEPPD		LALTEPLEIN
LEPPGPLTLA		MSQFLNEMQE		TKKGVVTPKE		LFSQVCKKAV		RFKGYQQQDS
QELLRYLLDG		MRAEEHQRVS		KGILKAFGNS		TEKLDEELKN		KVKDYEKKKS
MPSFVDRIFG		GELTSMIMCD		QCRTVSLVHE		SFLDLSLPVL		DDQSGKKSVN
DKNLKKTVED		EDQDSEEEKD		NDSYIKERSD		IPSGTSKHLQ		KKAKKQAKKQ
AKNQRRQQKI		QGKVLHLNDI		CTIDHPEDSE		YEAEMSLQGE		VNIKSNHISQ
EGVMHKEYCV		NQKDLNGQAK		MIESVTDNQK		STEEVDMKNI		NMDNDLEVLT
SSPTRNLNGA		YLTEGSNGEV		DISNGFKNLN		LNAALHPDEI		NIEILNDSHT
PGTKVYEVVN		EDPETAFCTL		ANREVFNTDE		CSIQHCLYQF		TRNEKLRDAN
KLLCEVCTRR		QCNGPKANIK		GERKHVYTNA		KKQMLISLAP		PVLTLHLKRF
QQAGFNLRKV		NKHIKFPEIL		DLAPFCTLKC		KNVAEENTRV		LYSLYGVVEH
SGTMRSGHYT		AYAKARTANS		HLSNLVLHGD		IPQDFEMESK		GQWFHISDTH
VQAVPTTKVL		NSQAYLLFYE		RIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, активаторів, регуляторів хроматину, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Cai S.-Y., Babbitt R.W., Marchesi V.T. (1999). A mutant deubiquitinating enzyme (Ubp-M) associates with mitotic chromosomes and blocks cell division. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 2828—2833. PMID 10077596 DOI:10.1073/pnas.96.6.2828
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 21