USP33

USP33
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2UZG
Ідентифікатори
Символи	USP33, VDU1, ubiquitin specific peptidase 33
Зовнішні ІД	OMIM: 615146 MGI: 2159711 HomoloGene: 8996 GeneCards: USP33
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • G protein-coupled receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • центросома • комплекс Ґольджі • VCB complex • focal adhesion • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • autophagosome • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • гіалоплазма Біологічний процес • ендоцитоз • protein K48-linked deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • centrosome duplication • cellular response to starvation • protein stabilization • negative regulation of protein binding • протеоліз • axon guidance • regulation of autophagy • protein K63-linked deubiquitination • positive regulation of protein binding • cell migration • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23032	170822
Ensembl	ENSG00000077254	ENSMUSG00000025437
UniProt	Q8TEY7	Q8R5K2
RefSeq (мРНК)	NM_015017 NM_201624 NM_201626	NM_001076676 NM_001252486 NM_133247 NM_001355666
RefSeq (білок)	NP_055832 NP_963918 NP_963920 NP_001364359 NP_001364360 NP_001364361 NP_001364362 NP_001364363 NP_001364364 NP_001364365 NP_001364366 NP_001364367 NP_001364368	NP_001070144 NP_001239415 NP_573510 NP_001342595
Локус (UCSC)	Хр. 1: 77.7 – 77.76 Mb	Хр. 3: 152.05 – 152.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP33 (англ. Ubiquitin specific peptidase 33) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 942 амінокислот, а молекулярна маса — 106 727.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTGSNSHITI		LTLKVLPHFE		SLGKQEKIPN		KMSAFRNHCP		HLDSVGEITK
EDLIQKSLGT		CQDCKVQGPN		LWACLENRCS		YVGCGESQVD		HSTIHSQETK
HYLTVNLTTL		RVWCYACSKE		VFLDRKLGTQ		PSLPHVRQPH		QIQENSVQDF
KIPSNTTLKT		PLVAVFDDLD		IEADEEDELR		ARGLTGLKNI		GNTCYMNAAL
QALSNCPPLT		QFFLDCGGLA		RTDKKPAICK		SYLKLMTELW		HKSRPGSVVP
TTLFQGIKTV		NPTFRGYSQQ		DAQEFLRCLM		DLLHEELKEQ		VMEVEEDPQT
ITTEETMEED		KSQSDVDFQS		CESCSNSDRA		ENENGSRCFS		EDNNETTMLI
QDDENNSEMS		KDWQKEKMCN		KINKVNSEGE		FDKDRDSISE		TVDLNNQETV
KVQIHSRASE		YITDVHSNDL		STPQILPSNE		GVNPRLSASP		PKSGNLWPGL
APPHKKAQSA		SPKRKKQHKK		YRSVISDIFD		GTIISSVQCL		TCDRVSVTLE
TFQDLSLPIP		GKEDLAKLHS		SSHPTSIVKA		GSCGEAYAPQ		GWIAFFMEYV
KRFVVSCVPS		WFWGPVVTLQ		DCLAAFFARD		ELKGDNMYSC		EKCKKLRNGV
KFCKVQNFPE		ILCIHLKRFR		HELMFSTKIS		THVSFPLEGL		DLQPFLAKDS
PAQIVTYDLL		SVICHHGTAS		SGHYIAYCRN		NLNNLWYEFD		DQSVTEVSES
TVQNAEAYVL		FYRKSSEEAQ		KERRRISNLL		NIMEPSLLQF		YISRQWLNKF
KTFAEPGPIS		NNDFLCIHGG		VPPRKAGYIE		DLVLMLPQNI		WDNLYSRYGG
GPAVNHLYIC		HTCQIEAEKI		EKRRKTELEI		FIRLNRAFQK		EDSPATFYCI
SMQWFREWES		FVKGKDGDPP		GPIDNTKIAV		TKCGNVMLRQ		GADSGQISEE
TWNFLQSIYG		GGPEVILRPP		VVHVDPDILQ		AEEKIEVETR		SL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ендоцитоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jeong J.Y., Wang Y., Sytkowski A.J. (2009). Human selenium binding protein-1 (hSP56) interacts with VDU1 in a selenium-dependent manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 379: 583—588. PMID 19118533 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.12.110
• Berthouze M., Venkataramanan V., Li Y., Shenoy S.K. (2009). The deubiquitinases USP33 and USP20 coordinate beta2 adrenergic receptor recycling and resensitization. EMBO J. 28: 1684—1696. PMID 19424180 DOI:10.1038/emboj.2009.128
• Thorne C., Eccles R.L., Coulson J.M., Urbe S., Clague M.J. (2011). Isoform-specific localization of the deubiquitinase USP33 to the Golgi apparatus. Traffic. 12: 1563—1574. PMID 21801292 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01261.x
• Allen M.D., Bycroft M. (2007). The solution structure of the ZnF UBP domain of USP33/VDU1. Protein Sci. 16: 2072—2075. PMID 17766394 DOI:10.1110/ps.072967807

Див. також

• Хромосома 1