USP38

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
USP38
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи USP38, HP43.8KD, ubiquitin specific peptidase 38
Зовнішні ІД OMIM: 618322 MGI: 1922091 HomoloGene: 12367 GeneCards: USP38
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001290325
NM_001290326
NM_032557
NM_027554
RefSeq (білок)
NP_001277254
NP_001277255
NP_115946
NP_081830
Локус (UCSC) Хр. 4: 143.18 – 143.22 Mb Хр. 8: 81.71 – 81.74 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

USP38 (англ. Ubiquitin specific peptidase 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 042 амінокислот, а молекулярна маса — 116 546[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIVRKVVESAEHWLDEAQCEAMFDLTTRLIL
EGQDPFQRQVGHQVLEAYARYHRPEFESFFNKTFVLGLLHQGYHSLDRKD
VAILDYIHNGLKLIMSCPSVLDLFSLLQVEVLRMVCERPEPQLCARLSDL
LTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQCVSTQERELREYVSQVTKVSN
LLQNIWKAEPATLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASLVQHIPLQMIT
VLIRSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAV
QKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHL
IVPHVVNLVHSFKNDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILE
AIKDFPKPSEEKIKLILNQSAWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINL
GNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNGCNSLMKKLQHLFAFLAHTQR
EAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRLHEEEKILKVQASHK
PSEILECSETSLQEVASKAAVLTETPRTSDGEKTLIEKMFGGKLRTHIRC
LNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENMSVQDPASSPSIQDGGLMQASV
PGPSEEPVVYNPTTAAFICDSLVNEKTIGSPPNEFYCSENTSVPNESNKI
LVNKDVPQKPGGETTPSVTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEK
TMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLVLELPVKRITSF
SSLSESWSVDVDFTDLSENLAKKLKPSGTDEASCTKLVPYLLSSVVVHSG
ISSESGHYYSYARNITSTDSSYQMYHQSEALALASSQSHLLGRDSPSAVF
EQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQH
STNGLSGNNPTSGLWINGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARAL
QAASASCSFRPNGFDDNDPPGSCGPTGGGGGGGFNTVGRLVF

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20067 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q8NB14 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]