USP40

USP40
Ідентифікатори
Символи	USP40, ubiquitin specific peptidase 40
Зовнішні ІД	OMIM: 610570 MGI: 2443184 HomoloGene: 32400 GeneCards: USP40
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • protein deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • regulation of protein stability Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55230	227334
Ensembl	ENSG00000085982	ENSMUSG00000005501
UniProt	Q9NVE5	Q8BWR4
RefSeq (мРНК)	NM_018218 NM_001365479	NM_001033291 NM_001198573
RefSeq (білок)	NP_060688 NP_001352408 NP_001369224 NP_001369225 NP_001369226 NP_001369227 NP_001369228 NP_001369229 NP_001369230 NP_001369231 NP_001369232	NP_001028463 NP_001185502
Локус (UCSC)	Хр. 2: 233.48 – 233.57 Mb	Хр. 1: 87.95 – 88.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP40 (англ. Ubiquitin specific peptidase 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 235 амінокислот, а молекулярна маса — 140 130.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFGDLFEEEY		STVSNNQYGK		GKKLKTKALE		PPAPREFTNL		SGIRNQGGTC
YLNSLLQTLH		FTPEFREALF		SLGPEELGLF		EDKDKPDAKV		RIIPLQLQRL
FAQLLLLDQE		AASTADLTDS		FGWTSNEEMR		QHDVQELNRI		LFSALETSLV
GTSGHDLIYR		LYHGTIVNQI		VCKECKNVSE		RQEDFLDLTV		AVKNVSGLED
ALWNMYVEEE		VFDCDNLYHC		GTCDRLVKAA		KSAKLRKLPP		FLTVSLLRFN
FDFVKCERYK		ETSCYTFPLR		INLKPFCEQS		ELDDLEYIYD		LFSVIIHKGG
CYGGHYHVYI		KDVDHLGNWQ		FQEEKSKPDV		NLKDLQSEEE		IDHPLMILKA
ILLEENNLIP		VDQLGQKLLK		KIGISWNKKY		RKQHGPLRKF		LQLHSQIFLL
SSDESTVRLL		KNSSLQAESD		FQRNDQQIFK		MLPPESPGLN		NSISCPHWFD
INDSKVQPIR		EKDIEQQFQG		KESAYMLFYR		KSQLQRPPEA		RANPRYGVPC
HLLNEMDAAN		IELQTKRAEC		DSANNTFELH		LHLGPQYHFF		NGALHPVVSQ
TESVWDLTFD		KRKTLGDLRQ		SIFQLLEFWE		GDMVLSVAKL		VPAGLHIYQS
LGGDELTLCE		TEIADGEDIF		VWNGVEVGGV		HIQTGIDCEP		LLLNVLHLDT
SSDGEKCCQV		IESPHVFPAN		AEVGTVLTAL		AIPAGVIFIN		SAGCPGGEGW
TAIPKEDMRK		TFREQGLRNG		SSILIQDSHD		DNSLLTKEEK		WVTSMNEIDW
LHVKNLCQLE		SEEKQVKISA		TVNTMVFDIR		IKAIKELKLM		KELADNSCLR
PIDRNGKLLC		PVPDSYTLKE		AELKMGSSLG		LCLGKAPSSS		QLFLFFAMGS
DVQPGTEMEI		VVEETISVRD		CLKLMLKKSG		LQGDAWHLRK		MDWCYEAGEP
LCEEDATLKE		LLICSGDTLL		LIEGQLPPLG		FLKVPIWWYQ		LQGPSGHWES
HQDQTNCTSS		WGRVWRATSS		QGASGNEPAQ		VSLLYLGDIE		ISEDATLAEL
KSQAMTLPPF		LEFGVPSPAH		LRAWTVERKR		PGRLLRTDRQ		PLREYKLGRR
IEICLEPLQK		GENLGPQDVL		LRTQVRIPGE		RTYAPALDLV		WNAAQGGTAG
SLRQRVADFY		RLPVEKIEIA		KYFPEKFEWL		PISSWNQQIT		KRKKKKKQDY
LQGAPYYLKD		GDTIGVKNLL		IDDDDDFSTI		RDDTGKEKQK		QRALGRRKSQ
EALHEQSSYI		LSSAETPARP		RAPETSLSIH		VGSFR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2